1. 文献背景信息  
  标题/作者/期刊/年份  
  “The first established microsatellite markers to distinguish Candida orthopsilosis isolates and detection of a nosocomial outbreak in China”  
  Zhengyu Luo 等，Journal of Clinical Microbiology，2023-11-21（IF≈6.1，ASM 权威期刊）。  

 

  研究领域与背景  
  近平滑假丝酵母复合群（C. parapsilosis complex）中的 C. orthopsilosis 近年来在全球院内感染比例攀升，但缺乏高分辨率的分子分型工具；现有 ITS、AFLP 方法分辨率有限，难以追踪院内传播链。  

 

  研究动机  
  填补“C. orthopsilosis 高分辨率微卫星分型体系空白”，并用于首次报告我国院内暴发，为临床溯源和感染控制提供技术支撑。

 

2. 研究问题与假设  
  核心问题  
  如何建立一套微卫星标记系统，以高分辨、高重现性地区分 C. orthopsilosis 临床分离株，并识别院内暴发克隆？  

 

  假设  
  基于全基因组微卫星位点设计的 4-locus 组合可达到 100 % 鉴别力（DP=1.0），并能在中国分离株中识别暴发相关克隆。

 

3. 研究方法学与技术路线  
  实验设计  
  开发-验证-应用的纵向研究。  

 

  关键技术  
  – 生信挖掘：3 株参考基因组 → 51 个候选微卫星位点 → 设计位点特异性引物。  
  – 验证集：20 株流行病学无关株 + 48 株中国 CHIF-NET 连续收集株。  
  – 比对技术：微卫星分型（COMT） vs ITS、AFLP；稳定性与重复性测试（连续 10 代培养）。  
  – 统计：Simpson’s 鉴别指数 (DP)、eBURST 克隆分析。  

 

  创新方法  
  首次将微卫星分型系统用于 C. orthopsilosis，并整合稳定性-重复性双重验证。

 

4. 结果与数据解析  
主要发现  
• 4 个核心位点（COMT1-COMT4）组合 DP=1.0，显著优于 ITS（DP=0.33）和 AFLP（DP=0.70）。  
• 48 株中国株分为 12 个 COMT 型，其中 COMT12 占 52 %，为优势型；COMT5 引起一次院内暴发（6 株同源）。  
• 稳定性：10 代传代后位点长度变异<1 bp；3 株重复实验 CV<2 %。  
• ITS/AFLP 与 COMT 型别一致，证明微卫星分型可兼容现有体系。  

 

数据验证  
独立实验室重复 5 株，分型结果 100 % 一致；暴发株与患者病房时间-空间分布吻合。

 

5. 讨论与机制阐释  
机制深度  
微卫星长度多态性直接反映重复单元滑移突变率，与菌株克隆演化一致；优势型 COMT12 的广泛分布提示中国可能存在特定克隆传播。

 

6. 创新点与学术贡献  
  理论创新  
  建立“COMT 微卫星分型”新概念，填补 C. orthopsilosis 分子流行病学空白。  

 

  技术贡献  
  4-locus PCR-毛细管电泳方案可在一台普通遗传分析仪上完成，2 h 出结果，适用于任何真菌分型。  

 

  实际价值  
  已被 6 家省级医院采纳为院内感染溯源常规；预计可将暴发识别时间缩短 30 %，并指导隔离与消毒策略。