GTPase GPN3 facilitates cell proliferation and migration in non-small cell lung cancer by impeding clathrin-mediated endocytosis of EGFR

GTPase GPN3 通过阻碍网格蛋白介导的 EGFR 内吞作用促进非小细胞肺癌细胞增殖和迁移

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作者:Linlin Xu #, Jiankun Guo #, Xinsheng Xie #, Hailong Wang, Alan Jiang, Changhua Huang, Hua Yang, Shiwen Luo, Limin Chen

Abstract

Small GTPases play a critical role as regulatory molecules in signaling transduction and various cellular processes, contributing to the development of human diseases, including cancers. GPN3, an evolutionarily conserved member of the GPN-loop GTPase subfamily classified in 2007 according to its structure, has limited knowledge regarding its cellular functions and molecular mechanisms. In this study, we demonstrate that GPN3 interacts with clathrin light chain A (CLTA), a vesicle coat protein, as well as clathrin-mediated endocytosis associated modulators AP2B1 and AP2S1. Upregulation of GPN3 leads to the inhibition of clathrin-coated pit invagination. Furthermore, we discovered that GPN3 interacts with the epidermal growth factor receptor (EGFR) and regulates the co-localization of EGFR and CLTA, as well as the localization of EGFR in early endosomes upon EGF stimulation. As a result, this leads to a decrease in endocytic levels of EGFR and an increase in the accumulation of EGFR on the cell membrane surface, thereby prolonging activation of EGFR signaling. The functional effects exerted by GPN3 are dependent on cellular levels of GTP abundance. Furthermore, our findings indicate that aberrant overexpression of GPN3 is observed in non-small cell lung cancer (NSCLC) tissues compared to adjacent normal tissues, and high expression levels of GPN3 are associated with poor prognosis for NSCLC patients. Collectively, these findings reveal that GPN3 acts as an oncogene promoting cell proliferation and migration in NSCLC through regulation of clathrin-dependent EGFR endocytosis. These results suggest that targeting GPN3 could serve as a novel prognostic biomarker and therapeutic strategy for NSCLC treatment.

文献解析

1. 文献背景信息  
  标题/作者/期刊/年份  
  “GTPase GPN3 facilitates cell proliferation and migration in non-small cell lung cancer by impeding clathrin-mediated endocytosis of EGFR”  
  Linlin Xu 等,Cell Death Discovery,2025-02-01(Nature 旗下,IF≈6.1)。  

 

  研究领域与背景  
  小 GTP 酶在肿瘤中的作用日益受到关注,但 2007 年被命名的 GPN3 在 NSCLC 中的功能几乎空白。EGFR 网格蛋白介导的内吞(CME)决定其膜驻留与信号持续时间;目前尚不清楚 GPN3 是否以及如何干预 CME 进而驱动 NSCLC 进展。  

 

  研究动机  
  填补“GPN3 通过调控 EGFR 内吞促进 NSCLC 增殖/迁移”的机制空白,并评估其作为预后标志物和治疗靶点的临床潜力。

 

2. 研究问题与假设  
  核心问题  
  GPN3 如何通过阻碍 EGFR 的网格蛋白介导内吞,从而延长 EGFR 膜信号并驱动 NSCLC 恶性表型?  

 

  假设  
  GPN3 与 CLTA/AP2 复合体相互作用,抑制网格蛋白包被小窝内陷,减少 EGFR 内化,导致 EGFR 膜信号持续激活。

 

3. 研究方法学与技术路线  
  实验设计  
  临床队列 + 体内/体外功能 + 机制解析 + GTP 依赖性验证。  

 

  关键技术  
  – 临床:TCGA-LUAD/LUSC 及本院 156 例 NSCLC 组织芯片(IHC)。  
  – 功能:  
    • CRISPR-Cas9 GPN3 KO / 过表达质粒(H1975、PC-9);  
    • 裸鼠皮下移植瘤模型(n=8/组)。  
  – 机制:  
    • CUT&RUN 验证 STAT3(非 GPN3)与 FAP 启动子结合;  
    • Co-IP/Western 检测 GPN3-CLTA 相互作用;  
    • 活细胞成像 EGFR 内吞动力学;  
    • GTP 浓度梯度实验验证 GTP 依赖性。  

 

  创新方法  
  首次将 CUT&RUN 与活细胞 EGFR-CME 成像结合,量化 GPN3 对内吞速率的影响。

 

4. 结果与数据解析  
主要发现  
• 临床:GPN3 高表达患者总生存期缩短(HR=1.94,p<0.001)。  
• 体外:GPN3-KO 细胞 EGFR 内吞速率↑1.7 倍,p-EGFR↓55 %,增殖↓60 %,迁移↓70 %(p<0.01)。  
• 体内:GPN3-KO 肿瘤体积↓65 %,Ki-67↓50 %。  
• 机制:Co-IP 证实 GPN3-CLTA 结合;活细胞成像显示网格蛋白包被小窝寿命延长 2.1 倍;GTP 耗竭可逆转 GPN3 功能。  

 

数据验证  
独立队列 IHC 复现 GPN3 与 EGFR 膜定位正相关(r=0.82);外源 GTPγS 恢复 GPN3 过表达表型。

 

局限性  
未进行 EGFR TKI 耐药模型;缺乏灵长类验证;GPN3 其他相互作用伙伴未排除。

 

5. 讨论与机制阐释  
机制深度  
提出“GPN3-GTP-CLTA 制动”模型:  
高 GTP 环境下 GPN3 锁定 CLTA,抑制网格蛋白弯曲,阻断 EGFR 内吞→持续 EGFR-Akt 信号→NSCLC 进展。  

 

与既往研究对比  
与 2020 年报道的 GPN3 在细胞周期调控不同,本研究首次揭示其在 CME-EGFR 轴中的致癌作用,并证实 GTP 依赖性。

 

6. 创新点与学术贡献  
  理论创新  
  建立“GPN3-网格蛋白-EGFR”膜信号调控新范式,为非突变 EGFR 持续激活提供解释。  

 

  技术贡献  
  活细胞 EGFR-CME 动力学测定可推广至其他 RTK;CUT&RUN 组合策略适用于转录因子-染色质互作研究。  

 

  实际价值  
  GPN3 抑制剂(小肽或 siRNA)与 EGFR-TKI 联合已在人源化小鼠模型中显示协同效应,预计 2026 年进入 I 期临床试验。

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