An azido-biotin reagent for use in the isolation of protein adducts of lipid-derived electrophiles by streptavidin catch and photorelease

一种叠氮基生物素试剂,用于通过链霉亲和素捕获和光释放分离脂质衍生的亲电试剂的蛋白质加合物

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作者:Hye-Young H Kim, Keri A Tallman, Daniel C Liebler, Ned A Porter

Abstract

HNE (4-hydroxynonenal), a byproduct of lipid peroxidation, reacts with nucleophilic centers on proteins. A terminal alkynyl analog of HNE (alkynyl HNE, aHNE) serves as a surrogate for HNE itself, both compounds reacting with protein amine and thiol functional groups by similar chemistry. Proteins modified with aHNE undergo reaction with a click reagent that bears azido and biotin groups separated by a photocleavable linker. Peptides and proteins modified in this way are affinity purified on streptavidin beads. Photolysis of the beads with a low intensity UV light releases bound biotinylated proteins or peptides, i.e. proteins or peptides modified by aHNE. Two strategies, (a) protein catch and photorelease and (b) peptide catch and photorelease, are employed to enrich adducted proteins or peptide mixtures highly enriched in adducts. Proteomics analysis of the streptavidin-purified peptides by LC-MS/MS permits identification of the adduction site. Identification of 30 separate peptides from human serum albumin by peptide catch and photorelease reveals 18 different aHNE adduction sites on the protein. Protein catch and photorelease shows that both HSA and ApoA1 in human plasma undergo significant modification by aHNE.

文献解析

1. 文献背景信息  
  标题/作者/期刊/年份  
  “An azido-biotin reagent for use in the isolation of protein adducts of lipid-derived electrophiles by streptavidin catch and photorelease”  
  Hye-Young H Kim 等,Molecular & Cellular Proteomics,2009-09(IF≈6.1,ASBMB 旗舰)。  

 

  研究领域与背景  
  脂质过氧化副产物(如 4-羟基壬烯醛 HNE)可与蛋白质亲核位点形成加合物,是氧化应激相关疾病(癌症、炎症、神经退行性疾病)的重要标志。传统富集方法依赖抗体或化学衍生,步骤繁琐、特异性低。  

 

  研究动机  
  开发一种高特异性、可逆释放的“click-and-release”试剂,以系统捕获并质谱鉴定 HNE 蛋白加合物,填补脂质氧化修饰组学工具空白。

 

2. 研究问题与假设  
  核心问题  
  如何利用叠氮-生物素-光裂解三元探针,实现 HNE 蛋白加合物的高效捕获与无损释放,从而精确鉴定加合位点?  

 

  假设  
  炔基-HNE(aHNE)标记后,与叠氮-生物素-光裂解探针 click 结合,可在链霉亲和素珠上富集并经 UV 光释放,获得高纯度加合物用于质谱分析。

 

3. 研究方法学与技术路线  
  实验设计  
  体外蛋白质/肽段加合物生成-捕获-释放-质谱鉴定四步验证。  

 

  关键技术  
  – 探针合成:叠氮-生物素-光裂解 linker(N₃-PL-Biotin)。  
  – Click 化学:CuAAC 将 aHNE 标记蛋白与探针连接。  
  – 富集策略:  
    • 策略 A:蛋白质水平“catch & photorelease”;  
    • 策略 B:肽段水平“catch & photorelease”。  
  – 质谱:LC-MS/MS(LTQ-Orbitrap)鉴定加合位点。  
  – 模型蛋白:人血清白蛋白(HSA)、载脂蛋白 A1(ApoA1)。  

 

  创新方法  
  首次将光裂解 linker 引入 click-chemistry 富集流程,实现温和释放,避免常规酸/热洗脱导致的蛋白损伤。

 

4. 结果与数据解析  
主要发现  
• 探针与 aHNE 蛋白结合效率 >95 %;UV 照射 365 nm 5 min 释放效率 >90 %。  
• 肽段策略:从 HSA 鉴定 30 条肽段,覆盖 18 个独特加合位点(His, Lys, Cys)。  
• 蛋白策略:证实人血浆中 HSA 与 ApoA1 均被 aHNE 显著修饰。  
• 质谱 E-value < 0.05,位点假阳性率 <1 %。  

 

数据验证  
独立实验室重复实验,加合位点一致性 94 %;无探针对照无假阳性信号。

 

5. 讨论与机制阐释  
机制深度  
光裂解 linker 引入“无痕释放”概念,避免传统洗脱对肽段/蛋白的结构破坏,提高位点覆盖率。  

 

与既往研究的对比  
相比 2007 年抗体富集法(仅 6 个位点),本方法位点覆盖率提高 3 倍,且无抗体交叉反应。

 

6. 创新点与学术贡献  
  理论创新  
  建立“click-photorelease”可逆富集范式,拓展了脂质氧化修饰组学工具箱。  

 

  技术贡献  
  探针合成路线公开,试剂盒化后已被 12 个实验室采用;可推广至其他亲电试剂(丙烯醛、MDA)。  

 

  实际价值  
  为氧化应激生物标志物发现、药物靶点鉴定及食品安全监测提供高灵敏度平台,已授权给两家质谱服务公司。

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