Localization of the quantitative trait loci related to lodging resistance in spring bread wheat (Triticum aestivum L.)

春小麦(Triticum aestivum L.)抗倒伏相关数量性状基因座的定位

阅读:5
作者:I N Leonova, E V Ageeva

Abstract

Russian The yield and grain quality of spring and winter wheat signif icantly depends on varieties' resistance to lodging, the genetic basis of this trait being quantitative and controlled by a large number of loci. Therefore, the study of the genetic architecture of the trait becomes necessary for the creation and improvement of modern wheat varieties. Here we present the results of localization of the genomic regions associated with resistance to lodging, plant height, and upper internode diameter in Russian bread wheat varieties. Phenotypic screening of 97 spring varieties and breeding lines was carried out in the f ield conditions of the West Siberian region during 2017-2019. It was found that 54 % of the varieties could be characterized as medium and highly resistant to lodging. At the same time, it was noted that the trait varied over the years. Twelve varieties showed a low level of resistance in all years of evaluation. Plant height-based grouping of the varieties showed that 19 samples belonged to semi-dwarfs (60-84 cm), and the rest were included in the group of standard-height plants (85-100 cm). Quantitative trait loci (QTL) mapping was performed by means of genome-wide association study (GWAS) using 9285 SNP markers. For lodging resistance, plant height, and upper internode diameter, 26 signif icant associations (-log p > 3) were found in chromosomes 1B, 2A, 3A, 3D, 4A, 5A, 5B, 5D, 6A, and 7B. The results obtained suggest that the regions of 700-711 and 597-618 Mb in chromosomes 3A and 6A, respectively, may contain clusters of genes that affect lodging resistance and plant height. No chromosome regions colocalized with the QTLs as sociated with lodging resistance or upper internode diameter were found. The present GWAS results may be important for the development of approaches for creating lodging-resistant varieties through marker-assisted and genomic selection. Урожайность и качество зерна яровой и озимой пшеницы в значительной степени зависят от устойчивости сортов к полеганию. Генетический контроль устойчивости к полеганию носит количественный характер и контролируется большим числом генных локусов, поэтому изучение генетической архитектуры данного признака необходимо для создания и усовершенствования современных сортов. В работе представлены результаты по выявлению геномных районов, ассоциированных с устойчивостью к полеганию и сопряженными с ним признаками «высота растения» и «диаметр верхнего междоузлия» у российских сортов яровой мягкой пшеницы. Фенотипический скрининг 97 яровых сортов и селекционных линий мягкой пшеницы был проведен в полевых условиях Западно-Сибирского региона в 2017–2019 гг. Установлено, что 54 % сортообразцов можно охарактеризовать как средне- и высокоустойчивые к полеганию, при этом отмечено варьирование признака по годам. Двенадцать сортов проявляли низкий уровень устойчивости во все годы проведения испытаний. Группировка растений по высоте показала, что 19 образцов относятся к полукарликам (60–84 см), остальные вошли в группу низкорослых растений (85–100 см). Картирование локусов было проведено с помощью полногеномного ассоциативного (GWA) анализа с использованием 9285 маркеров SNP. Для признаков «устойчивость к полеганию», «высота растения» и «диаметр верхнего междоузлия» найдено 26 значимых ассоциаций (–log p > 3) в хромосомах 1B, 2A, 3A, 3D, 4A, 5A, 5B, 5D, 6A и 7B. Полученные результаты позволяют предположить, что районы 700–711 и 597–618 Mb хромосом 3А и 6А соответственно могут содержать кластеры генов, влияющих на устойчивость к полеганию и высоту растения. Не обнаружено районов хромосом с колокализацией локусов, ассоциированных с устойчивостью к полеганию и диаметром верхнего междоузлия. Данные GWA анализа могут иметь значение для разработки методов создания устойчивых к полеганию сортов с помощью маркер-ориентированной и геномной селекции.

特别声明

1、本页面内容包含部分的内容是基于公开信息的合理引用;引用内容仅为补充信息,不代表本站立场。

2、若认为本页面引用内容涉及侵权,请及时与本站联系,我们将第一时间处理。

3、其他媒体/个人如需使用本页面原创内容,需注明“来源:[生知库]”并获得授权;使用引用内容的,需自行联系原作者获得许可。

4、投稿及合作请联系:info@biocloudy.com。