日期:
2020 年 — 2026 年
2020
2021
2022
2023
2024
2025
2026
影响因子:

The evolution of gene regulation in mammalian cerebellum development

哺乳动物小脑发育过程中基因调控的演变

Sarropoulos, Ioannis; Sepp, Mari; Yamada, Tetsuya; Schäfer, Philipp S L; Trost, Nils; Schmidt, Julia; Schneider, Céline; Drummer, Charis; Mißbach, Sophie; Taskiran, Ibrahim I; Hecker, Nikolai; Bravo González-Blas, Carmen; Frömel, Robert; Joshi, Piyush; Leushkin, Evgeny; Arnskötter, Frederik; Leiss, Kevin; Okonechnikov, Konstantin; Lisgo, Steven; Palkovits, Miklós; Pääbo, Svante; Cardoso-Moreira, Margarida; Kutscher, Lena M; Behr, Rüdiger; Pfister, Stefan M; Aerts, Stein; Kaessmann, Henrik

Systematic benchmarking of single-cell ATAC-sequencing protocols

单细胞ATAC测序方案的系统性基准测试

Florian V De Rop ,Gert Hulselmans ,Chris Flerin ,Paula Soler-Vila ,Albert Rafels ,Valerie Christiaens ,Carmen Bravo González-Blas ,Domenica Marchese ,Ginevra Caratù ,Suresh Poovathingal ,Orit Rozenblatt-Rosen ,Michael Slyper ,Wendy Luo ,Christoph Muus ,Fabiana Duarte ,Rojesh Shrestha ,S Tansu Bagdatli ,M Ryan Corces ,Lira Mamanova ,Andrew Knights ,Kerstin B Meyer ,Ryan Mulqueen ,Akram Taherinasab ,Patrick Maschmeyer ,Jörn Pezoldt ,Camille Lucie Germaine Lambert ,Marta Iglesias ,Sebastián R Najle ,Zain Y Dossani ,Luciano G Martelotto ,Zach Burkett ,Ronald Lebofsky ,José Ignacio Martin-Subero ,Satish Pillai ,Arnau Sebé-Pedrós ,Bart Deplancke ,Sarah A Teichmann ,Leif S Ludwig ,Theodore P Braun ,Andrew C Adey ,William J Greenleaf ,Jason D Buenrostro ,Aviv Regev ,Stein Aerts ,Holger Heyn

Single-cell spatial multi-omics and deep learning dissect enhancer-driven gene regulatory networks in liver zonation

单细胞空间多组学和深度学习解析肝脏分区中增强子驱动的基因调控网络

Carmen Bravo González-Blas ,Irina Matetovici ,Hanne Hillen ,Ibrahim Ihsan Taskiran ,Roel Vandepoel ,Valerie Christiaens ,Leticia Sansores-García ,Elisabeth Verboven ,Gert Hulselmans ,Suresh Poovathingal ,Jonas Demeulemeester ,Nikoleta Psatha ,David Mauduit ,Georg Halder ,Stein Aerts

SCENIC+: single-cell multiomic inference of enhancers and gene regulatory networks

SCENIC+:增强子和基因调控网络的单细胞多组学推断

Carmen Bravo González-Blas #, Seppe De Winter #, Gert Hulselmans, Nikolai Hecker, Irina Matetovici, Valerie Christiaens, Suresh Poovathingal, Jasper Wouters, Sara Aibar, Stein Aerts

Shared enhancer gene regulatory networks between wound and oncogenic programs

伤口和致癌程序之间共享增强子基因调控网络

Swann Floc'hlay, Ramya Balaji, Dimitrije Stanković, Valerie M Christiaens, Carmen Bravo González-Blas, Seppe De Winter, Gert J Hulselmans, Maxime De Waegeneer, Xiaojiang Quan, Duygu Koldere, Mardelle Atkins, Georg Halder, Mirka Uhlirova, Anne-Kathrin Classen, Stein Aerts

Hydrop enables droplet-based single-cell ATAC-seq and single-cell RNA-seq using dissolvable hydrogel beads

Hydrop 利用可溶解的水凝胶珠实现基于液滴的单细胞 ATAC 测序和单细胞 RNA 测序

Florian V De Rop, Joy N Ismail, Carmen Bravo González-Blas, Gert J Hulselmans, Christopher Campbell Flerin, Jasper Janssens, Koen Theunis, Valerie M Christiaens, Jasper Wouters, Gabriele Marcassa, Joris de Wit, Suresh Poovathingal #, Stein Aerts #

Identification of genomic enhancers through spatial integration of single-cell transcriptomics and epigenomics

通过单细胞转录组学和表观基因组学的空间整合来识别基因组增强子

Carmen Bravo González-Blas, Xiao-Jiang Quan, Ramon Duran-Romaña, Ibrahim Ihsan Taskiran, Duygu Koldere, Kristofer Davie, Valerie Christiaens, Samira Makhzami, Gert Hulselmans, Maxime de Waegeneer, David Mauduit, Suresh Poovathingal, Sara Aibar, Stein Aerts

cisTopic: cis-regulatory topic modeling on single-cell ATAC-seq data

cisTopic:单细胞 ATAC-seq 数据的顺式调控主题建模

Carmen Bravo González-Blas #, Liesbeth Minnoye #, Dafni Papasokrati, Sara Aibar, Gert Hulselmans, Valerie Christiaens, Kristofer Davie, Jasper Wouters, Stein Aerts

A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Aging Drosophila Brain

果蝇大脑衰老的单细胞转录组图谱

Kristofer Davie, Jasper Janssens, Duygu Koldere, Maxime De Waegeneer, Uli Pech, Łukasz Kreft, Sara Aibar, Samira Makhzami, Valerie Christiaens, Carmen Bravo González-Blas, Suresh Poovathingal, Gert Hulselmans, Katina I Spanier, Thomas Moerman, Bram Vanspauwen, Sarah Geurs, Thierry Voet, Jeroen Lamme

Mapping gene regulatory networks from single-cell omics data

利用单细胞组学数据绘制基因调控网络图谱

Fiers, Mark W E J; Minnoye, Liesbeth; Aibar, Sara; Bravo González-Blas, Carmen; Kalender Atak, Zeynep; Aerts, Stein