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Single-Cell Hi-C Technologies and Computational Data Analysis

单细胞高通量碳技术及计算数据分析

期刊:Advanced Science

影响因子:14.1

doi:10.1002/advs.202412232

Dautle, Madison A; Chen, Yong

细胞生物学

发表日期：2025

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Inferring gene regulatory networks from time-series scRNA-seq data via GRANGER causal recurrent autoencoders

利用 GRANGER 因果循环自编码器从时间序列 scRNA-seq 数据推断基因调控网络

期刊:Briefings in Bioinformatics

影响因子:7.7

doi:10.1093/bib/bbaf089

Chen, Liang; Dautle, Madison; Gao, Ruoying; Zhang, Shaoqiang; Chen, Yong

发表日期：2025

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Histone Acetylation Differentially Modulates CTCF-CTCF Loops and Intra-TAD Interactions.

组蛋白乙酰化差异性地调节 CTCF-CTCF 环和 TAD 内相互作用

doi:10.1101/2025.07.29.667515

Smith Rebecca G, Fu Yu, Schiela Kathleen L, Dautle Madison, Williams Ryan, Wilson Hannah M, Azadegan Chloe, Whetstine Johnathan R, Dekker Job, Liu Yu

发表日期：2025

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scTIGER: A Deep-Learning Method for Inferring Gene Regulatory Networks from Case versus Control scRNA-seq Datasets

scTIGER：一种利用病例对照单细胞RNA测序数据集推断基因调控网络的深度学习方法

期刊:International Journal of Molecular Sciences

影响因子:4.9

doi:10.3390/ijms241713339

Dautle, Madison; Zhang, Shaoqiang; Chen, Yong

细胞生物学

发表日期：2023

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