日期 影响因子
日期:
2020 年 — 2026 年
2020
2021
2022
2023
2024
2025
2026
影响因子:
–

Multimodal-based analysis of single-cell ATAC-seq data enables highly accurate delineation of clinically relevant tumor cell subpopulations

基于多模态的单细胞ATAC-seq数据分析能够高度精确地划分具有临床意义的肿瘤细胞亚群。

期刊:Genome Medicine
影响因子:11.2
doi:10.1186/s13073-026-01599-w
Xiong, Kewei; Wang, Wei; Ding, Ruofan; Luo, Dinglin; Qin, Yangmei; Zou, Xudong; Wang, Jiguang; Yu, Chen; Li, Lei
肿瘤
肿瘤免疫
细胞生物学
肿瘤细胞
单细胞
发表日期：2026
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scQTLbase: an integrated human single-cell eQTL database

scQTLbase：一个整合的人类单细胞eQTL数据库

期刊:Nucleic Acids Research
影响因子:13.1
doi:10.1093/nar/gkad781
Ding, Ruofan; Wang, Qixuan; Gong, Lihai; Zhang, Ting; Zou, Xudong; Xiong, Kewei; Liao, Qi; Plass, Mireya; Li, Lei
细胞生物学
单细胞
发表日期：2024
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eRNA-IDO: A One-stop Platform for Identification, Interactome Discovery, and Functional Annotation of Enhancer RNAs

eRNA-IDO：用于增强子RNA鉴定、互作组发现和功能注释的一站式平台

期刊:Genomics Proteomics & Bioinformatics
影响因子:7.9
doi:10.1093/gpbjnl/qzae059
Zhang, Yuwei; Gong, Lihai; Ding, Ruofan; Chen, Wenyan; Rong, Hao; Li, Yanguo; Shameem, Fawziya; Ali, Korakkandan Arshad; Li, Lei; Liao, Qi
IDO
发表日期：2024
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Immune-response 3'UTR alternative polyadenylation quantitative trait loci contribute to variation in human complex traits and diseases

免疫应答3'UTR选择性多聚腺苷酸化数量性状基因座导致人类复杂性状和疾病的变异。

期刊:Nature Communications
影响因子:15.7
doi:10.1038/s41467-023-44191-1
Li, Lei; Ma, Xuelian; Cui, Ya; Rotival, Maxime; Chen, Wenyan; Zou, Xudong; Ding, Ruofan; Qin, Yangmei; Wang, Qixuan; Quintana-Murci, Lluis; Li, Wei
免疫/内分泌
发表日期：2023
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ipaQTL-atlas: an atlas of intronic polyadenylation quantitative trait loci across human tissues

ipaQTL-atlas：人类组织内含子多聚腺苷酸化数量性状基因座图谱

期刊:Nucleic Acids Research
影响因子:13.1
doi:10.1093/nar/gkac736
Ma, Xuelian; Cheng, Shumin; Ding, Ruofan; Zhao, Zhaozhao; Zou, XuDong; Guang, Shouhong; Wang, Qixuan; Jing, Huan; Yu, Chen; Ni, Ting; Li, Lei
发表日期：2023
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xQTLbiolinks: a comprehensive and scalable tool for integrative analysis of molecular QTLs

xQTLbiolinks：用于分子QTL整合分析的全面且可扩展的工具

期刊:Briefings in Bioinformatics
影响因子:7.7
doi:10.1093/bib/bbad440
Ding, Ruofan; Zou, Xudong; Qin, Yangmei; Gong, Lihai; Chen, Hui; Ma, Xuelian; Guang, Shouhong; Yu, Chen; Wang, Gao; Li, Lei
发表日期：2023
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Determination of the Amino Acid Recruitment Order in Early Life by Genome-Wide Analysis of Amino Acid Usage Bias

通过全基因组氨基酸使用偏好分析确定早期生命阶段氨基酸募集顺序

期刊:Biomolecules
影响因子:4.8
doi:10.3390/biom12020171
Zhao, Mingxiao; Ding, Ruofan; Liu, Yan; Ji, Zhiliang; Zhao, Yufen
发表日期：2022
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Using population-scale transcriptomic and genomic data to map 3' UTR alternative polyadenylation quantitative trait loci

利用群体规模的转录组和基因组数据绘制3'UTR可变多聚腺苷酸化数量性状位点图谱

期刊:STAR Protocols
影响因子:1.3
doi:10.1016/j.xpro.2022.101566
Zou, Xudong; Ding, Ruofan; Chen, Wenyan; Wang, Gao; Cheng, Shumin; Wang, Qin; Li, Wei; Li, Lei
发表日期：2022
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Genome-wide Identification and Characterization of Enhancers Across 10 Human Tissues

10种人类组织中增强子的全基因组鉴定和表征

期刊:International Journal of Biological Sciences
影响因子:10
doi:10.7150/ijbs.26605
Xiong, Lili; Kang, Ran; Ding, Ruofan; Kang, Wenyuan; Zhang, Yiming; Liu, Wenrong; Huang, Qingqing; Meng, Junhua; Guo, Zhiyun
Human
发表日期：2018
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Comprehensive Expression Profiling and Functional Network Analysis of p53-Regulated MicroRNAs in HepG2 Cells Treated with Doxorubicin.

对阿霉素处理的 HepG2 细胞中 p53 调控的 microRNA 进行全面的表达谱分析和功能网络分析

期刊:PLoS One
影响因子:2.6
doi:10.1371/journal.pone.0149227
Yang Yalan, Liu Wenrong, Ding Ruofan, Xiong Lili, Dou Rongkun, Zhang Yiming, Guo Zhiyun
细胞生物学
P53
发表日期：2016
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