日期 影响因子
日期:
2020 年 — 2026 年
2020
2021
2022
2023
2024
2025
2026
影响因子:
–

Human brain vascular multi-omics elucidates disease-risk associations.

人脑血管多组学阐明疾病风险关联

期刊:Neuron
影响因子:15
doi:10.1016/j.neuron.2025.07.001
Reid Madigan M, Menon Shreya, Liu Hao, Zhou Haoyue, Hu Zhirui, Frerich Simon, Ding Bella, Oveisgharan Shahram, Zhang Zimo, Nelson Sophia, Apolonio Amanda, Bennett David A, Dichgans Martin, Pollard Katherine S, Corces M Ryan, Yang Andrew C
心血管
Human
发表日期：2025
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CellWalker2: Multi-omic discovery using hierarchical cell type relationships

CellWalker2：利用层级细胞类型关系进行多组学发现

期刊:Cell Genomics
影响因子:9
doi:10.1016/j.xgen.2025.100886
Hu, Zhirui; Przytycki, Pawel F; Pollard, Katherine S
细胞生物学
发表日期：2025
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Protocol for inferring cell type relationships and linking genomic annotations to cell type hierarchies using CellWalker2

使用 CellWalker2 推断细胞类型关系并将基因组注释与细胞类型层级结构关联起来的方案

期刊:STAR Protocols
影响因子:1.3
doi:10.1016/j.xpro.2025.104235
Hu, Zhirui; Przytycki, Pawel F; Pollard, Katherine S
细胞生物学
发表日期：2025
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Practical Guidance and Workflows for Identifying Fast Evolving Non-Coding Genomic Elements Using PhyloAcc

利用 PhyloAcc 识别快速演化的非编码基因组元件的实用指南和工作流程

期刊:Integrative and Comparative Biology
影响因子:2.1
doi:10.1093/icb/icae056
Thomas, Gregg W C; Gemmell, Patrick; Shakya, Subir B; Hu, Zhirui; Liu, Jun S; Sackton, Timothy B; Edwards, Scott V
发表日期：2024
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CellWalker2: multi-omic discovery of hierarchical cell type relationships and their associations with genomic annotations

CellWalker2：多组学发现细胞类型层级关系及其与基因组注释的关联

期刊:
影响因子:
doi:10.1101/2024.05.17.594770
Hu, Zhirui; Przytycki, Pawel F; Pollard, Katherine S
细胞生物学
发表日期：2024
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scATAnno: Automated Cell Type Annotation for single-cell ATAC Sequencing Data

scATAnno：单细胞ATAC测序数据的自动化细胞类型注释

期刊:
影响因子:
doi:10.1101/2023.06.01.543296
Jiang, Yijia; Hu, Zhirui; Lynch, Allen W; Jiang, Junchen; Zhu, Alexander; Zeng, Ziqi; Zhang, Yi; Wu, Gongwei; Xie, Yingtian; Li, Rong; Zhou, Ningxuan; Meyer, Cliff; Cejas, Paloma; Brown, Myles; Long, Henry W; Qiu, Xintao
细胞生物学
单细胞
发表日期：2024
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PhyloAcc-GT: A Bayesian Method for Inferring Patterns of Substitution Rate Shifts on Targeted Lineages Accounting for Gene Tree Discordance

PhyloAcc-GT：一种用于推断目标谱系上替换速率变化模式并考虑基因树不一致性的贝叶斯方法

期刊:Molecular Biology and Evolution
影响因子:5.3
doi:10.1093/molbev/msad195
Yan, Han; Hu, Zhirui; Thomas, Gregg W C; Edwards, Scott V; Sackton, Timothy B; Liu, Jun S
发表日期：2023
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SIMPLEs: a single-cell RNA sequencing imputation strategy preserving gene modules and cell clusters variation

SIMPLEs：一种保留基因模块和细胞簇变异的单细胞RNA测序插补策略

期刊:NAR Genomics and Bioinformatics
影响因子:2.8
doi:10.1093/nargab/lqaa077
Hu, Zhirui; Zu, Songpeng; Liu, Jun S
细胞生物学
MPL
单细胞
发表日期：2020
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Bayesian Detection of Convergent Rate Changes of Conserved Noncoding Elements on Phylogenetic Trees

基于贝叶斯方法检测系统发育树上保守非编码元件的趋同速率变化

期刊:Molecular Biology and Evolution
影响因子:5.3
doi:10.1093/molbev/msz049
Hu, Zhirui; Sackton, Timothy B; Edwards, Scott V; Liu, Jun S
发育与干细胞
发表日期：2019
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Novel Markov model of induced pluripotency predicts gene expression changes in reprogramming

诱导多能性的新型马尔可夫模型预测重编程过程中基因表达的变化

期刊:BMC Systems Biology
影响因子:
doi:10.1186/1752-0509-5-S2-S8
Hu, Zhirui; Qian, Minping; Zhang, Michael Q
发表日期：2011
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