日期 影响因子
日期:
2020 年 — 2026 年
2020
2021
2022
2023
2024
2025
2026
影响因子:
–

Transcriptomic analyses reveal regulatory plasticity and metabolic reprogramming underlying genotype-specific microspore embryogenesis in wheat

转录组分析揭示了小麦基因型特异性小孢子胚胎发生过程中调控可塑性和代谢重编程的机制。

期刊:Plant Cell Reports
影响因子:4.5
doi:10.1007/s00299-026-03731-x
Yuan, Hai Ying; Jiang, Yunfei; Kathiria, Palak; Bollina, Venkatesh; Tan, Yifang; Enns, Jean L; Ferrie, Alison M R; Kagale, Sateesh
信号转导
代谢重编程
代谢
发表日期：2026
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ChromBPNet: bias factorized, base-resolution deep learning models of chromatin accessibility reveal cis-regulatory sequence syntax, transcription factor footprints and regulatory variants

ChromBPNet：基于偏差分解的、碱基分辨率的染色质可及性深度学习模型揭示顺式调控序列语法、转录因子足迹和调控变异

期刊:
影响因子:
doi:10.1101/2024.12.25.630221
Pampari, Anusri; Shcherbina, Anna; Kvon, Evgeny Z; Kosicki, Michael; Nair, Surag; Kundu, Soumya; Kathiria, Arwa S; Risca, Viviana I; Kuningas, Kristiina; Alasoo, Kaur; Greenleaf, William James; Pennacchio, Len A; Kundaje, Anshul
信号转导
发表日期：2025
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NEAT-seq: simultaneous profiling of intra-nuclear proteins, chromatin accessibility and gene expression in single cells

NEAT-seq：单细胞内核蛋白、染色质可及性和基因表达的同步分析

期刊:Nature Methods
影响因子:36.1
doi:10.1038/s41592-022-01461-y
Amy F Chen ，Benjamin Parks ，Arwa S Kathiria ，Benjamin Ober-Reynolds ，Jorg J Goronzy ，William J Greenleaf
细胞生物学
单细胞
发表日期：2022
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Systematic discovery and perturbation of regulatory genes in human T cells reveals the architecture of immune networks

对人类T细胞中调控基因的系统性发现和扰动揭示了免疫网络的结构

期刊:Nature Genetics
影响因子:31.7
doi:10.1038/s41588-022-01106-y
Jacob W Freimer # ，Oren Shaked # ，Sahin Naqvi ，Nasa Sinnott-Armstrong ，Arwa Kathiria ，Christian M Garrido ，Amy F Chen ，Jessica T Cortez ，William J Greenleaf ，Jonathan K Pritchard ，Alexander Marson
T细胞
信号转导
免疫/内分泌
细胞生物学
T细胞
发表日期：2022
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The dynamic, combinatorial cis-regulatory lexicon of epidermal differentiation

表皮分化的动态组合顺式调控词汇

期刊:Nature Genetics
影响因子:31.7
doi:10.1038/s41588-021-00947-3
Daniel S Kim, Viviana I Risca, David L Reynolds, James Chappell, Adam J Rubin, Namyoung Jung, Laura K H Donohue, Vanessa Lopez-Pajares, Arwa Kathiria, Minyi Shi, Zhixin Zhao, Harsh Deep, Mahfuza Sharmin, Deepti Rao, Shin Lin, Howard Y Chang, Michael P Snyder, William J Greenleaf, Anshul Kundaje, Pau
信号转导
发表日期：2021
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Single-cell transcriptomic analysis of the adult mouse spinal cord reveals molecular diversity of autonomic and skeletal motor neurons

成年小鼠脊髓单细胞转录组分析揭示自主神经和骨骼运动神经元的分子多样性

期刊:Nature Neuroscience
影响因子:21.2
doi:10.1038/s41593-020-00795-0
Jacob A Blum, Sandy Klemm #, Jennifer L Shadrach #, Kevin A Guttenplan, Lisa Nakayama, Arwa Kathiria, Phuong T Hoang, Olivia Gautier, Julia A Kaltschmidt, William J Greenleaf, Aaron D Gitler
神经
其它细胞
Mouse
发表日期：2021
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Integrated single-cell transcriptomics and epigenomics reveals strong germinal center-associated etiology of autoimmune risk loci

整合单细胞转录组学和表观基因组学揭示了生发中心与自身免疫风险位点密切相关的病因

期刊:Science Immunology
影响因子:16.3
doi:10.1126/sciimmunol.abh3768
King, Hamish W; Wells, Kristen L; Shipony, Zohar; Kathiria, Arwa S; Wagar, Lisa E; Lareau, Caleb; Orban, Nara; Capasso, Robson; Davis, Mark M; Steinmetz, Lars M; James, Louisa K; Greenleaf, William J
细胞生物学
表观遗传
单细胞
免疫/内分泌
发表日期：2021
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Single-cell multiomic analysis identifies regulatory programs in mixed-phenotype acute leukemia

单细胞多组学分析确定混合表型急性白血病中的调控程序

期刊:Nature Biotechnology
影响因子:33.1
doi:10.1038/s41587-019-0332-7
Jeffrey M Granja #, Sandy Klemm #, Lisa M McGinnis #, Arwa S Kathiria, Anja Mezger, M Ryan Corces, Benjamin Parks, Eric Gars, Michaela Liedtke, Grace X Y Zheng, Howard Y Chang, Ravindra Majeti, William J Greenleaf7
免疫
细胞生物学
白血病
肿瘤细胞
发表日期：2019
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Landscape of stimulation-responsive chromatin across diverse human immune cells

不同人类免疫细胞中刺激反应染色质的景观

期刊:Nature Genetics
影响因子:31.7
doi:10.1038/s41588-019-0505-9
Diego Calderon #, Michelle L T Nguyen #, Anja Mezger #, Arwa Kathiria, Fabian Müller, Vinh Nguyen, Ninnia Lescano, Beijing Wu, John Trombetta, Jessica V Ribado, David A Knowles, Ziyue Gao, Franziska Blaeschke, Audrey V Parent, Trevor D Burt, Mark S Anderson, Lindsey A Criswell, William J Greenleaf, 
免疫
其它细胞
发表日期：2019
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An improved ATAC-seq protocol reduces background and enables interrogation of frozen tissues

改进的 ATAC-seq 协议可减少背景并实现对冷冻组织的检测

期刊:Nature Methods
影响因子:36.1
doi:10.1038/nmeth.4396
M Ryan Corces, Alexandro E Trevino, Emily G Hamilton, Peyton G Greenside, Nicholas A Sinnott-Armstrong, Sam Vesuna, Ansuman T Satpathy, Adam J Rubin, Kathleen S Montine, Beijing Wu, Arwa Kathiria, Seung Woo Cho, Maxwell R Mumbach, Ava C Carter, Maya Kasowski, Lisa A Orloff, Viviana I Risca, Anshul K
信号转导
发表日期：2017
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