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RoCK and ROI: single-cell transcriptomics with multiplexed enrichment of selected transcripts and region-specific sequencing

RoCK 和 ROI：单细胞转录组学，可对选定的转录本进行多重富集和区域特异性测序

期刊:Nature Communications

影响因子:14.7

doi:10.1038/s41467-025-66248-z

Giulia Moro # ，Izaskun Mallona # ，Malwine J Barz ，Joël Maillard ，Michael David Brügger ，Hassan Fazilaty ，Quentin Szabo ，Tomas Valenta ，Kristina Handler ，Fiona Kerlin ，Lorenz Bastian ，Claudia D Baldus ，Andreas E Moor ，Robert Zinzen ，Mark D Robinson ，Erich Brunner ，Konrad Basler

发表日期：2025

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Systematic discovery of subcellular RNA patterns in the gut epithelium

系统性地发现肠道上皮细胞亚细胞RNA模式

期刊:Genome Biology

影响因子:10.1

doi:10.1186/s13059-025-03786-1.

Minkyoung Lee,Ilhan E Acar,Davide Eletto,Srivathsan Adivarahan,Farah Mhamedi,Kristina Handler,Jihyun Lee,Elena Guido Vinzoni,Gustavo Aguilar,Andreas E Moor

细胞生物学

发表日期：2025

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In vivo interaction screening reveals liver-derived constraints to metastasis

体内相互作用筛选揭示肝脏来源的转移限制

影响因子:50.5

doi:10.1038/s41586-024-07715-3

Costanza Borrelli ，Morgan Roberts ，Davide Eletto ，Marie-Didiée Hussherr ，Hassan Fazilaty ，Tomas Valenta ，Atefeh Lafzi ，Jonas A Kretz ，Elena Guido Vinzoni ，Andromachi Karakatsani ，Srivathsan Adivarahan ，Ardian Mannhart ，Shoichiro Kimura ，Ab Meijs ，Farah Baccouche Mhamedi ，Ilhan E Acar ，Kristina Handler ，Xenia Ficht ，Randall J Platt ，Salvatore Piscuoglio ，Andreas E Moor

发表日期：2024

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Identifying Spatial Co-occurrence in Healthy and InflAmed tissues (ISCHIA)

识别健康和炎症组织中的空间共现性（ISCHIA）

期刊:Molecular Systems Biology

影响因子:8.5

doi:10.1038/s44320-023-00006-5

Atefeh Lafzi # ,Costanza Borrelli # ,Simona Baghai Sain ,Karsten Bach ,Jonas A Kretz ,Kristina Handler ,Daniel Regan-Komito ,Xenia Ficht ,Andreas Frei ,Andreas Moor

发表日期：2024

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Performance comparison of high throughput single-cell RNA-Seq platforms in complex tissues

复杂组织中高通量单细胞RNA测序平台的性能比较

影响因子:3.4

doi:10.1016/j.heliyon.2024.e37185

Yolanda Colino-Sanguino ，Laura Rodriguez de la Fuente ，Brian Gloss ，Andrew M K Law ，Kristina Handler ，Marina Pajic ，Robert Salomon ，David Gallego-Ortega ，Fatima Valdes-Mora

细胞生物学

发表日期：2024

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Active eosinophils regulate host defence and immune responses in colitis

活性嗜酸性粒细胞调节结肠炎中的宿主防御和免疫反应

影响因子:50.5

doi:10.1038/s41586-022-05628-7

Alessandra Gurtner # ，Costanza Borrelli # ，Ignacio Gonzalez-Perez ，Karsten Bach ，Ilhan E Acar ，Nicolás G Núñez ，Daniel Crepaz ，Kristina Handler ，Vivian P Vu ，Atefeh Lafzi ，Kristin Stirm ，Deeksha Raju ，Julia Gschwend ，Konrad Basler ，Christoph Schneider ，Emma Slack ，Tomas Valenta ，Burkhard Becher ，Philippe Krebs ，Andreas E Moor ，Isabelle C Arnold

细胞生物学

免疫/内分泌

发表日期：2023

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TiO2 nanoparticles abrogate the protective effect of the Crohn's disease-associated variation within the PTPN22 gene locus

TiO2 纳米粒子消除了 PTPN22 基因位点内克罗恩病相关变异的保护作用

影响因子:23

doi:10.1136/gutjnl-2021-325911

Marlene Schwarzfischer, Anna Niechcial, Kristina Handler, Yasser Morsy, Marcin Wawrzyniak, Andrea S Laimbacher, Kirstin Atrott, Roberto Manzini, Katharina Baebler, Larissa Hering, Egle Katkeviciutė, Janine Häfliger, Silvia Lang, Maja E Keller, Jérôme Woodtli, Lisa Eisenbeiss, Thomas Kraemer, Elisabe

发表日期：2023

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Fragment-sequencing unveils local tissue microenvironments at single-cell resolution

片段测序以单细胞分辨率揭示局部组织微环境

期刊:Nature Communications

影响因子:14.7

doi:10.1038/s41467-023-43005-8

Kristina Handler ,Karsten Bach ,Costanza Borrelli ,Salvatore Piscuoglio ,Xenia Ficht ,Ilhan E Acar ,Andreas E Moor

细胞生物学

发表日期：2023

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A massively parallel reporter assay reveals focused and broadly encoded RNA localization signals in neurons

大规模并行报告基因检测揭示了神经元中集中且广泛编码的 RNA 定位信号

期刊:Nucleic Acids Research

影响因子:16.6

doi:10.1093/nar/gkac806

Martin Mikl, Davide Eletto, Malak Nijim, Minkyoung Lee, Atefeh Lafzi, Farah Mhamedi, Orit David, Simona Baghai Sain, Kristina Handler, Andreas E Moor

发表日期：2022

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Differential regulation of β-catenin-mediated transcription via N- and C-terminal co-factors governs identity of murine intestinal epithelial stem cells

通过 N 端和 C 端辅助因子对 β-catenin 介导的转录进行差异调节，决定小鼠肠上皮干细胞的身份

期刊:Nature Communications

影响因子:14.7

doi:10.1038/s41467-021-21591-9

Costanza Borrelli #, Tomas Valenta #, Kristina Handler, Karelia Vélez, Alessandra Gurtner, Giulia Moro, Atefeh Lafzi, Laura de Vargas Roditi, George Hausmann, Isabelle C Arnold, Andreas E Moor, Konrad Basler

发育与干细胞

发表日期：2021

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