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日期:
2020 年 — 2026 年
2020
2021
2022
2023
2024
2025
2026
影响因子:
–
筛选
DeepMolecules: a web server for predicting enzyme and transporter-small molecule interactions
DeepMolecules:一个用于预测酶和转运蛋白与小分子相互作用的Web服务器
期刊:
Nucleic Acids Research
影响因子:
13.1
doi:
10.1093/nar/gkaf343
Kroll, Alexander; Rousset, Yvan; Spitzlei, Thomas; Lercher, Martin J
Horizontal Gene Transfer Inference: Gene Presence-Absence Outperforms Gene Trees
水平基因转移推断:基因存在与否优于基因树
期刊:
Molecular Biology and Evolution
影响因子:
5.3
doi:
10.1093/molbev/msaf166
Mishra, Swastik; Lercher, Martin J
SPOT: A machine learning model that predicts specific substrates for transport proteins
SPOT:一种预测转运蛋白特定底物的机器学习模型
期刊:
PLoS Biology
影响因子:
7.2
doi:
10.1371/journal.pbio.3002807
Kroll, Alexander; Niebuhr, Nico; Butler, Gregory; Lercher, Martin J
A multimodal Transformer Network for protein-small molecule interactions enhances predictions of kinase inhibition and enzyme-substrate relationships
用于蛋白质-小分子相互作用的多模态Transformer网络增强了对激酶抑制和酶-底物关系的预测。
期刊:
PLoS Computational Biology
影响因子:
3.6
doi:
10.1371/journal.pcbi.1012100
Kroll, Alexander; Ranjan, Sahasra; Lercher, Martin J
信号转导
DLKcat cannot predict meaningful k (cat) values for mutants and unfamiliar enzymes
DLKcat 无法预测突变体和未知酶的有意义的 k(cat) 值。
期刊:
Biology Methods and Protocols
影响因子:
1.3
doi:
10.1093/biomethods/bpae061
Kroll, Alexander; Lercher, Martin J
A general model to predict small molecule substrates of enzymes based on machine and deep learning
基于机器学习和深度学习的酶小分子底物预测通用模型
期刊:
Nature Communications
影响因子:
15.7
doi:
10.1038/s41467-023-38347-2
Kroll, Alexander; Ranjan, Sahasra; Engqvist, Martin K M; Lercher, Martin J
Turnover number predictions for kinetically uncharacterized enzymes using machine and deep learning
利用机器学习和深度学习预测动力学未表征酶的周转数
期刊:
Nature Communications
影响因子:
15.7
doi:
10.1038/s41467-023-39840-4
Kroll, Alexander; Rousset, Yvan; Hu, Xiao-Pan; Liebrand, Nina A; Lercher, Martin J
Proteome efficiency of metabolic pathways in Escherichia coli increases along the nutrient flow
大肠杆菌代谢途径的蛋白质组效率随营养流的增加而提高
期刊:
mSystems
影响因子:
4.6
doi:
10.1128/msystems.00760-23
Hu, Xiao-Pan; Schroeder, Stefan; Lercher, Martin J
代谢
Mathematical properties of optimal fluxes in cellular reaction networks at balanced growth
平衡生长状态下细胞反应网络中最优通量的数学特性
期刊:
PLoS Computational Biology
影响因子:
3.6
doi:
10.1371/journal.pcbi.1011156
Dourado, Hugo; Liebermeister, Wolfram; Ebenhöh, Oliver; Lercher, Martin J
细胞生物学
Optimal density of bacterial cells
细菌细胞的最佳密度
期刊:
PLoS Computational Biology
影响因子:
3.6
doi:
10.1371/journal.pcbi.1011177
Pang, Tin Yau; Lercher, Martin J
微生物学
细胞生物学
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