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Distinct principles of genome compartmentalization in Drosophila and humans revealed by osmotic stress

渗透胁迫揭示果蝇和人类基因组区室化的不同原则

doi:10.64898/2026.04.02.716189

Amankwaa, Bright; Playter, Christopher; Stow, Emily; Sanders, Jacob T; Xue, Tianchun; McCord, Rachel Patton; Labrador, Mariano

发表日期：2026

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Reversibility of Nuclear and 3D Genomic Changes in Non-Cancerous Fibroblasts After Constricted Migration

非癌性成纤维细胞在受限迁移后核和三维基因组变化的可逆性

doi:10.64898/2026.01.28.701973

Playter, Christopher; Benson, Samuel John; Dos Reis Marques, Renata; Young, Preston; Simmons, Timothy B; Perry, Kathryn; Swets, Amanda K; McCord, Rachel Patton

成纤维细胞

细胞生物学

发表日期：2026

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Polymer model integrates imaging and sequencing to reveal how nanoscale heterochromatin domains influence gene expression.

聚合物模型整合了成像和测序技术，揭示了纳米级异染色质结构域如何影响基因表达

期刊:Nature Communications

影响因子:15.7

doi:10.1038/s41467-025-59001-z

Vinayak Vinayak, Basir Ramin, Golloshi Rosela, Toth Joshua, Sant'Anna Lucas, Lakadamyali Melike, McCord Rachel Patton, Shenoy Vivek B

发表日期：2025

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Rearrangement of 3D genome organization in breast cancer epithelial to mesenchymal transition and metastasis organotropism

乳腺癌上皮间质转化和转移器官趋向性中三维基因组结构的重排

影响因子:6.4

doi:10.7554/eLife.103697

Das, Priyojit; San Martin, Rebeca; Hong, Tian; McCord, Rachel Patton

上皮间质转化

发表日期：2025

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Deciphering pre-existing and induced 3D genome architecture changes involved in constricted melanoma migration.

解析与受限黑色素瘤迁移相关的预先存在和诱导的 3D 基因组结构变化

期刊:iScience

影响因子:4.1

doi:10.1016/j.isci.2025.112346

Playter Christopher, Golloshi Rosela, Garretson Joshua H, Rodriguez Gonzalez Alvaro, Olajide Taiwo Habeeb, Saad Ahmed, Benson Samuel John, McCord Rachel Patton

发表日期：2025

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Transient chromatin decompaction by histone deacetylation inhibition preferentially radiosensitizes cancerous breast epithelial cells at lower radiation doses

组蛋白去乙酰化抑制引起的瞬时染色质解压缩可优先增强癌变乳腺上皮细胞在较低辐射剂量下的放射敏感性。

doi:10.1101/2025.06.20.660786

Li, Heng; Maben, Campbell; Pal, Debjani; Davern, Sandra; McCord, Rachel Patton

细胞生物学

发表日期：2025

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Spatial genome reorganization is associated with chromosomal breakage regions and karyotype changes induced by programmed DNA elimination

空间基因组重组与染色体断裂区域和程序性DNA消除引起的核型变化有关

doi:10.1101/2025.10.23.684251

Simmons, James R; Xue, Tianchun; McCord, Rachel Patton; Wang, Jianbin

发表日期：2025

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Chromosome compartmentalization: causes, changes, consequences, and conundrums

染色体区室化：原因、变化、后果和难题

期刊:Trends in Cell Biology

影响因子:18.1

doi:10.1016/j.tcb.2024.01.009

Li, Heng; Playter, Christopher; Das, Priyojit; McCord, Rachel Patton

发表日期：2024

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Node features of chromosome structure networks and their connections to genome annotation

染色体结构网络的节点特征及其与基因组注释的联系

期刊:Computational and Structural Biotechnology Journal

影响因子:4.1

doi:10.1016/j.csbj.2024.05.026

Xu, Yingjie; Das, Priyojit; McCord, Rachel Patton; Shen, Tongye

发表日期：2024

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MASI enables fast model-free standardization and integration of single-cell transcriptomics data

MASI能够实现单细胞转录组数据的快速、无模型标准化和整合

期刊:Communications Biology

影响因子:5.1

doi:10.1038/s42003-023-04820-3

Xu, Yang; Kramann, Rafael; McCord, Rachel Patton; Hayat, Sikander

细胞生物学

发表日期：2023

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