日期 影响因子
日期:
2020 年 — 2026 年
2020
2021
2022
2023
2024
2025
2026
影响因子:
–

krepp: a k-mer-based maximum pseudo-likelihood method for estimating read distances and genome-wide phylogenetic placement

krepp：一种基于k-mer的最大伪似然法，用于估计读段距离和全基因组系统发育位置。

期刊:Genome Biology
影响因子:9.4
doi:10.1186/s13059-026-03999-y
Şapcı, Ali Osman Berk; Mirarab, Siavash
发育与干细胞
发表日期：2026
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SPrUCE: Utilizing Ultraconserved Elements of DNA for Population-Level Genetic Diversity Estimation

SPrUCE：利用DNA超保守元件进行群体遗传多样性估计

期刊:Molecular Ecology Resources
影响因子:5.5
doi:10.1111/1755-0998.70145
Melendez, Daira; Şapcı, Ali Osman Berk; Bafna, Vineet; Mirarab, Siavash
发表日期：2026
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Deconvolving Phylogenetic Distance Mixtures

反卷积系统发育距离混合物

期刊:
影响因子:
doi:10.64898/2026.01.18.700179
Arasti, Shayesteh; Şapcı, Ali Osman Berk; Rachtman, Eleonora; El-Kebir, Mohammed; Mirarab, Siavash
发育与干细胞
发表日期：2026
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CASTER: Direct species tree inference from whole-genome alignments

CASTER：基于全基因组比对直接推断物种树

期刊:Science
影响因子:45.8
doi:10.1126/science.adk9688
Zhang, Chao; Nielsen, Rasmus; Mirarab, Siavash
发表日期：2025
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Net rate of lateral gene transfer in marine prokaryoplankton

海洋原核浮游生物横向基因转移的净速率

期刊:ISME Journal
影响因子:10
doi:10.1093/ismejo/wraf159
Stepanauskas, Ramunas; Brown, Julia M; Arasti, Shayesteh; Mai, Uyen; Gavelis, Gregory; Pachiadaki, Maria; Bezuidt, Oliver; Munson-McGee, Jacob H; Chang, Tianyi; Biller, Steven J; Berube, Paul M; Mirarab, Siavash
发表日期：2025
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Accurate, scalable, and fully automated inference of species trees from raw genome assemblies using ROADIES

使用 ROADIES 从原始基因组组装中准确、可扩展且全自动地推断物种树。

期刊:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
影响因子:9.1
doi:10.1073/pnas.2500553122
Gupta, Anshu; Mirarab, Siavash; Turakhia, Yatish
发表日期：2025
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Machine Learning Enables Alignment-Free Distance Calculation and Phylogenetic Placement Using k-Mer Frequencies

机器学习利用k-mer频率实现无需比对的距离计算和系统发育定位

期刊:Molecular Ecology Resources
影响因子:5.5
doi:10.1111/1755-0998.70055
Rachtman, Eleonora; Jiang, Yueyu; Mirarab, Siavash
发育与干细胞
发表日期：2025
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ASTER: A Package for Large-Scale Phylogenomic Reconstructions

ASTER：用于大规模系统发育基因组重建的软件包

期刊:Molecular Biology and Evolution
影响因子:5.3
doi:10.1093/molbev/msaf172
Zhang, Chao; Nielsen, Rasmus; Mirarab, Siavash
发育与干细胞
发表日期：2025
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Species Tree Branch Length Estimation despite Incomplete Lineage Sorting, Duplication, and Loss

尽管存在不完全谱系分选、复制和丢失，物种树分支长度估计仍然适用

期刊:Genome Biology and Evolution
影响因子:2.8
doi:10.1093/gbe/evaf200
Tabatabaee, Yasamin; Zhang, Chao; Arasti, Shayesteh; Mirarab, Siavash
发表日期：2025
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Computer-aided drug repurposing & discovery for Hepatitis B capsid protein

计算机辅助药物重定位与发现在乙型肝炎病毒衣壳蛋白中的应用

期刊:
影响因子:
doi:10.1007/s40203-025-00314-8
Mohebbi, Alireza; Nabavi, Seyed Pooria Tadayon; Naderi, Malihe; Sharifian, Kimia; Behnezhad, Farzane; Mohebbi, Maryam; Gholami, Amytis; Askari, Fatemeh Sana; Mirarab, Azam; Monavari, Seyed Hamidreza
微生物学
肝炎
发表日期：2025
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