日期 影响因子
日期:
2020 年 — 2026 年
2020
2021
2022
2023
2024
2025
2026
影响因子:
–

Controllable protein design via autoregressive direct coupling analysis conditioned on principal components

基于主成分的自回归直接耦合分析实现可控蛋白质设计

期刊:PLoS Computational Biology
影响因子:3.6
doi:10.1371/journal.pcbi.1013996
Caredda, Francesco; Gennai, Lisa; De Los Rios, Paolo; Pagnani, Andrea
发表日期：2026
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Reconstruction of Ancestral Protein Sequences Using Autoregressive Generative Models

利用自回归生成模型重建祖先蛋白质序列

期刊:Molecular Biology and Evolution
影响因子:5.3
doi:10.1093/molbev/msaf070
De Leonardis, Matteo; Pagnani, Andrea; Barrat-Charlaix, Pierre
发表日期：2025
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A competition network connects Rab5 and Rab11 GTPases at the surface of endocytic structures.

在内吞结构的表面，Rab5 和 Rab11 GTP 酶通过竞争网络连接起来

期刊:iScience
影响因子:4.1
doi:10.1016/j.isci.2025.112170
Ferro Elsi, Tealdi Simone, Margaria Jean Piero, De Santis Maria Chiara, Gozzelino Luca, Cunial Marta, Bena Chiara Enrico, Franco Irene, Hirsch Emilio, Gamba Andrea, Pagnani Andrea, Bosia Carla, Campa Carlo Cosimo
其它
发表日期：2025
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Direct coupling analysis and the attention mechanism

直接耦合分析和注意力机制

期刊:BMC Bioinformatics
影响因子:3.3
doi:10.1186/s12859-025-06062-y
Caredda, Francesco; Pagnani, Andrea
发表日期：2025
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Inference of annealed protein fitness landscapes with AnnealDCA

利用 AnnealDCA 推断退火蛋白质适应度景观

期刊:PLoS Computational Biology
影响因子:3.6
doi:10.1371/journal.pcbi.1011812
Sesta, Luca; Pagnani, Andrea; Fernandez-de-Cossio-Diaz, Jorge; Uguzzoni, Guido
发表日期：2024
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Inference and design of antibody specificity: From experiments to models and back

抗体特异性的推断与设计：从实验到模型再到实验

期刊:PLoS Computational Biology
影响因子:3.6
doi:10.1371/journal.pcbi.1012522
Fernandez-de-Cossio-Diaz, Jorge; Uguzzoni, Guido; Ricard, Kévin; Anselmi, Francesca; Nizak, Clément; Pagnani, Andrea; Rivoire, Olivier
发表日期：2024
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Unsupervised modeling of mutational landscapes of adeno-associated viruses viability

腺相关病毒生存能力突变景观的无监督建模

期刊:BMC Bioinformatics
影响因子:3.3
doi:10.1186/s12859-024-05823-5
De Leonardis, Matteo; Fernandez-de-Cossio-Diaz, Jorge; Uguzzoni, Guido; Pagnani, Andrea
微生物学
发表日期：2024
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DCAlign v1.0: aligning biological sequences using co-evolution models and informed priors

DCAlign v1.0：利用共进化模型和先验信息进行生物序列比对

期刊:
影响因子:
doi:10.1093/bioinformatics/btad537
Muntoni, Anna Paola; Pagnani, Andrea
发表日期：2023
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Generating interacting protein sequences using domain-to-domain translation

利用结构域到结构域的翻译生成相互作用的蛋白质序列

期刊:
影响因子:
doi:10.1093/bioinformatics/btad401
Meynard-Piganeau, Barthelemy; Fabbri, Caterina; Weigt, Martin; Pagnani, Andrea; Feinauer, Christoph
发表日期：2023
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Relationship between fitness and heterogeneity in exponentially growing microbial populations

指数增长微生物种群的适应度与异质性之间的关系

期刊:Biophysical Journal
影响因子:3.1
doi:10.1016/j.bpj.2022.04.012
Muntoni, Anna Paola; Braunstein, Alfredo; Pagnani, Andrea; De Martino, Daniele; De Martino, Andrea
微生物学
发表日期：2022
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