日期 影响因子
日期:
2020 年 — 2026 年
2020
2021
2022
2023
2024
2025
2026
影响因子:
–

Latent thermodynamic flows: unified representation learning and generative modeling of temperature-dependent behaviors from limited data

潜在热力学流：基于有限数据的温度相关行为的统一表征学习和生成建模

期刊:Chemical Science
影响因子:7.4
doi:10.1039/d5sc06402c
Qiu, Yunrui; John, Richard; Herron, Lukas; Tiwary, Pratyush
发表日期：2026
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Nucleosome condensate and linker DNA alter chromatin folding pathways and rates

核小体凝聚和连接DNA会改变染色质折叠途径和速率。

期刊:Biophysical Journal
影响因子:3.1
doi:10.1016/j.bpj.2025.11.2686
Qiu, Yunrui; Liu, Shuming; Lin, Xingcheng; Unarta, Ilona Christy; Huang, Xuhui; Zhang, Bin
发表日期：2026
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Ab initio prediction of RNA structure ensembles with RNAnneal

利用 RNAnneal 从头预测 RNA 结构集合

期刊:
影响因子:
doi:10.64898/2026.02.01.703098
Herron, Lukas; Qiu, Yunrui; Verma, Anjali; Sreyas Adury, Venkata Sai; John, Richard; Lee, Suemin; Mehdi, Shams; Sanwal, Disha; Schneekloth, John S Jr; Tiwary, Pratyush
发表日期：2026
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Unsupervised learning of structural relaxation in supercooled liquids from short-term fluctuations

基于短期波动的过冷液体结构弛豫的无监督学习

期刊:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
影响因子:9.1
doi:10.1073/pnas.2427246122
Qiu, Yunrui; Jang, Inhyuk; Huang, Xuhui; Yethiraj, Arun
发表日期：2025
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Non-Markovian Dynamic Models Identify Non-Canonical KRAS-VHL Encounter Complex Conformations for Novel PROTAC Design

非马尔可夫动态模型识别非典型 KRAS-VHL 遭遇复合物构象，用于新型 PROTAC 设计

期刊:JACS Au
影响因子:8.7
doi:10.1021/jacsau.4c00503
Qiu, Yunrui; Wiewiora, Rafal P; Izaguirre, Jesus A; Xu, Huafeng; Sherman, Woody; Tang, Weiping; Huang, Xuhui
RAS
VHL
发表日期：2024
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Information Bottleneck Approach for Markov Model Construction

马尔可夫模型构建的信息瓶颈方法

期刊:Journal of Chemical Theory and Computation
影响因子:5.5
doi:10.1021/acs.jctc.4c00449
Wang, Dedi; Qiu, Yunrui; Beyerle, Eric R; Huang, Xuhui; Tiwary, Pratyush
发表日期：2024
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Tutorial on how to build non-Markovian dynamic models from molecular dynamics simulations for studying protein conformational changes

本教程将介绍如何利用分子动力学模拟构建非马尔可夫动力学模型，以研究蛋白质构象变化。

期刊:Journal of Chemical Physics
影响因子:3.1
doi:10.1063/5.0189429
Wu, Yue; Cao, Siqin; Qiu, Yunrui; Huang, Xuhui
发表日期：2024
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An Efficient Path Classification Algorithm Based on Variational Autoencoder to Identify Metastable Path Channels for Complex Conformational Changes

一种基于变分自编码器的高效路径分类算法，用于识别复杂构象变化的亚稳态路径通道

期刊:Journal of Chemical Theory and Computation
影响因子:5.5
doi:10.1021/acs.jctc.3c00318
Qiu, Yunrui; O'Connor, Michael S; Xue, Mingyi; Liu, Bojun; Huang, Xuhui
发表日期：2023
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Integrative generalized master equation: A method to study long-timescale biomolecular dynamics via the integrals of memory kernels

积分广义主方程：一种利用记忆核积分研究长时间尺度生物分子动力学的方法

期刊:Journal of Chemical Physics
影响因子:3.1
doi:10.1063/5.0167287
Cao, Siqin; Qiu, Yunrui; Kalin, Michael L; Huang, Xuhui
发表日期：2023
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GraphVAMPnets for uncovering slow collective variables of self-assembly dynamics

用于揭示自组装动力学中缓慢集体变量的 GraphVAMPnets

期刊:Journal of Chemical Physics
影响因子:3.1
doi:10.1063/5.0158903
Liu, Bojun; Xue, Mingyi; Qiu, Yunrui; Konovalov, Kirill A; O'Connor, Michael S; Huang, Xuhui
发表日期：2023
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