日期 影响因子
日期:
2020 年 — 2026 年
2020
2021
2022
2023
2024
2025
2026
影响因子:
–

The interpretable multimodal dimension reduction framework SpaHDmap enhances resolution in spatial transcriptomics

可解释的多模态降维框架SpaHDmap提高了空间转录组学的分辨率

期刊:Nature Cell Biology
影响因子:19.1
doi:10.1038/s41556-025-01838-z
Tang, Junjie; Chen, Zihao; Qian, Kun; Huang, Siyuan; He, Yang; Yin, Shenyi; He, Xinyu; Ye, Buqing; Zhuang, Yan; Meng, Hongxue; Xi, Jianzhong Jeff; Xi, Ruibin
发表日期：2026
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Correction: Multi-model analysis of gallbladder cancer reveals the role of OxLDL-absorbing neutrophils in promoting liver invasion

更正：胆囊癌的多模型分析揭示了吸收氧化低密度脂蛋白（OxLDL）的中性粒细胞在促进肝脏侵袭中的作用

期刊:Experimental Hematology & Oncology
影响因子:13.5
doi:10.1186/s40164-025-00722-8
Rao, Dongning; Li, Jiaxin; Zhang, Mao; Huang, Siyuan; Meng, Lu; Song, Guohe; Ma, Jiaqiang; Wu, Yingcheng; Cheng, Yifei; Ji, Shuyi; Wu, Gaohua; Chen, Lv; Liu, Yuming; Shi, Yang; Zhou, Jian; Jia, Fan; Zhang, Xiaoming; Xi, Ruibin; Gao, Qiang
肿瘤
中性粒细胞
肿瘤免疫
粒细胞
胆囊癌
细胞生物学
发表日期：2025
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Detecting copy-number alterations from single-cell chromatin sequencing data by AtaCNA.

利用 AtaCNA 从单细胞染色质测序数据中检测拷贝数变异

期刊:Cell Reports Methods
影响因子:4.5
doi:10.1016/j.crmeth.2024.100939
Wang Xiaochen, Jin Zijie, Shi Yang, Xi Ruibin
细胞生物学
发表日期：2025
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Protocol for directly selecting cell type marker genes for single-cell clustering analyses by Festem

Festem 提出的用于单细胞聚类分析的直接选择细胞类型标记基因的方案

期刊:STAR Protocols
影响因子:1.3
doi:10.1016/j.xpro.2024.103514
Chen, Zihao; Wang, Changhu; Xi, Ruibin
细胞生物学
单细胞
发表日期：2025
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Benchmarking algorithms for spatially variable gene identification in spatial transcriptomics

空间转录组学中空间变异基因识别的基准算法

期刊:
影响因子:
doi:10.1093/bioinformatics/btaf131
Chen, Xuanwei; Ran, Qinghua; Tang, Junjie; Chen, Zihao; Huang, Siyuan; Shi, Xingjie; Xi, Ruibin
发表日期：2025
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TAGET: a toolkit for analyzing full-length transcripts from single molecular sequencing

TAGET：用于分析单分子测序全长转录本的工具包

期刊:
影响因子:
doi:10.1093/bib/bbaf631.028
Baek, Youngsoo; Berchuck, Samuel I; Mukherjee, Sayan; Xia, Yuchao; Miao, Susheng; Xi, Ruibin
发表日期：2025
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Evolutionary dependency of cancer mutations in gene pairs inferred by nonsynonymous-synonymous mutation ratios

通过非同义突变-同义突变比率推断基因对中癌症突变的进化依赖性

期刊:Genome Medicine
影响因子:11.2
doi:10.1186/s13073-024-01376-7
Han, Dong-Jin; Kim, Sunmin; Lee, Seo-Young; Moon, Youngbeen; Kang, Su Jung; Yoo, Jinseon; Jeong, Hye Young; Cho, Hae Jin; Jeon, Jeong Yang; Sim, Byeong Chang; Kim, Jaehoon; Lee, Seungho; Xi, Ruibin; Kim, Tae-Min
肿瘤
肿瘤免疫
发表日期：2024
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Directly selecting cell-type marker genes for single-cell clustering analyses

直接选择细胞类型标记基因进行单细胞聚类分析

期刊:Cell Reports Methods
影响因子:4.5
doi:10.1016/j.crmeth.2024.100810
Chen, Zihao; Wang, Changhu; Huang, Siyuan; Shi, Yang; Xi, Ruibin
细胞生物学
单细胞
发表日期：2024
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Identification of eight genes associated with recurrent patellar dislocation

鉴定出与复发性髌骨脱位相关的八个基因

期刊:iScience
影响因子:4.1
doi:10.1016/j.isci.2024.109697
Xu, Zijie; Huang, Siyuan; Song, Yifan; Xu, Chao; Yan, Hongyu; Linkun, Ouyang; Lv, Bo; Yuan, Fuzhen; Xu, Bingbing; Wang, Haijun; Xi, Ruibin; Yu, Jia-Kuo
发表日期：2024
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Single-cell gene regulatory network analysis for mixed cell populations

混合细胞群的单细胞基因调控网络分析

期刊:Quantitative Biology
影响因子:1.4
doi:10.1002/qub2.64
Tang, Junjie; Wang, Changhu; Xiao, Feiyi; Xi, Ruibin
信号转导
细胞生物学
单细胞
发表日期：2024
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