一、领域背景与期刊定位
2024-2025年生物信息学领域聚焦AI驱动的多组学数据分析（如Single-cell Multi-omics整合）、深度学习在蛋白质结构预测中的优化（AlphaFold衍生模型应用）及生物数据库标准化构建三大热点方向。该领域投稿痛点显著：68%的稿件因「方法学创新不足」或「与期刊数据规模要求不匹配」被拒稿^Nature Biotechnology 2025^。
领域趋势数据显示：2025年生物信息学期刊对「干湿实验结合」研究的录用率提升23%，纯生信分析稿件录用周期延长至平均145天，而《Bioinformation》因侧重工具实用性，审稿周期较同类期刊缩短20%^中科院文献情报中心 2025^。
二、核心数据解析：2025影响因子与分区
数据总览表
| 评价维度 | 具体数据 | 备注（2025年改革关联） |
|---|---|---|
| JCR影响因子（JIF） | 2.8（2024年数据，2025年暂未更新） | 分子已剔除2023-2024年撤稿引用，较2023年下降0.4 |
| JCR分区（小类/大类） | 小类：BIOINFORMATICS Q4；大类：生物学期刊 Q4 | 按「排名/学科期刊总数」划分，位于学科后25% |
| 中科院分区（小类/大类） | 小类：生物信息学 4区；大类：生物学 4区 | 基于「期刊超越指数」，1区为前5%期刊 |
| 自引率 | 18.7%（2024年） | 接近20%预警阈值，需关注引用分布合理性 |
| 审稿周期 | 平均42天（一审），整体录用周期168天 | 来自期刊2025年Author Guidelines |
数据解读
- 影响因子波动：2024年JIF下降主要因JCR新规剔除3篇高引撤稿论文（涉及CRISPR脱靶分析工具），但学科排名保持稳定（生物信息学领域128种期刊中排第101位）。
- 分区适配人群：中科院4区/JCR Q4定位适合硕士毕业要求、初期科研成果积累，或作为高影响力研究的预发表平台（如工具类论文先发表于本刊，后续扩展至《Bioinformatics》）。
- 自引风险提示：18.7%的自引率需警惕，投稿时建议减少引用本刊近3年论文（控制在参考文献总数的10%以内）。
三、投稿核心指南：注意事项与实战技巧
（1）投稿前基础注意事项
收稿范围匹配
明确拒收类型：- 纯理论数学模型（无生物学应用场景）；
- 未提供开源代码/数据库的工具类研究（需上传至GitHub/SRA并提供永久链接）；
- 临床样本量＜50例的组学分析（鼓励多中心合作数据）。
推荐使用JANE工具（Journal/Author Name Estimator）输入关键词（如「scRNA-seq+immune cell clustering+Python tool」），匹配度＞75%可尝试投稿。
格式规范
- 文档要求：LaTeX优先（提供Overleaf模板），Word格式需严格遵循「Title(14号加粗)→Abstract(250字)→Keywords(5个)→Introduction→Methods→Results→Discussion→Conclusion→References」结构；
- 核心材料：
- 伦理审查证明（仅涉及人类/动物数据时需提供）；
- 作者贡献声明（采用CRediT分类法：Conceptualization, Data curation等）；
- 代码可用性声明（强制要求，格式：「All code is available at https://github.com/XXX/XXX with DOI: 10.XXX/XXX」）。
- 参考文献：采用Vancouver格式，数量控制在40条以内，近5年文献占比≥60%。
费用与开放获取
- APC费用：1500美元（约合人民币10800元），提供发展中国家作者减免政策（需提交单位财务证明，可减免50%）；
- 开放获取要求：所有论文强制OA发表（无订阅模式），版权归作者所有（CC BY 4.0协议）。
（2）投稿高阶实战技巧
选题与创新点提炼
- 关键词交叉缺口策略：用VOSviewer分析本刊2022-2024年论文关键词共现网络，发现「单细胞空间转录组+肿瘤微环境」「长读长测序+微生物组组装」为新兴交叉方向（近1年发文量增长42%）。
- 摘要原创性凸显：结尾需明确标注创新点，例如：「To the best of our knowledge, this is the first tool to integrate base-calling error correction with haplotype phasing for Oxford Nanopore data.」
Cover Letter撰写
5句话模板（精准称呼主编Dr. Mark A. Ragan，从Editorial Board页面获取）：1. 领域背景：「Single-cell RNA-seq analysis of tumor-infiltrating lymphocytes requires robust batch effect correction to avoid false biological discoveries.」
2. 研究目标：「Here, we developed a novel algorithm (SCALER) to address this challenge by integrating mutual information maximization with deep residual networks.」
3. 核心方法：「We benchmarked SCALER against 8 existing tools using 12 public datasets (n=10,345 cells), showing 15-20% higher ARI score in cell type clustering.」
4. 关键发现：「Application to pancreatic cancer data revealed previously unreported CD8+ T cell subpopulation associated with PD-L1 expression.」
5. 期刊契合度：「This work aligns with Bioinformation’s focus on practical bioinformatics tools, as SCALER is freely available at https://github.com/XXX/SCALER with a user-friendly tutorial.」
审稿意见回应
典型问题与回应模板：- 问题：「为何未与Tool X比较性能？」
回应：「Tool X发表于2024年6月（投稿时尚未公开），现已补充比较分析（Supplementary Fig. 5），结果显示SCALER在内存占用率上降低30%（p<0.01, t-test）。」
- 问题：「样本量较小，结论可信度不足。」
回应：「已新增2个独立验证数据集（GSE214567和TCGA-PAAD），亚组分析结果一致（Supplementary Table 3）。」
四、实例参考与风险提示
成功案例
场景：某团队开发「基于深度学习的lncRNA亚细胞定位预测工具」，因样本量不足（仅2000条lncRNA序列）被《RNA Biology》拒稿后转投本刊，通过以下调整录用：1. 新增可解释性分析模块（SHAP值可视化，证明模型关注序列motif而非随机特征）；
2. 提供在线预测平台（http://lncLocator.sysu.edu.cn），并纳入300条独立实验验证数据作为测试集；
3. 参考文献仅引用本刊1篇论文（占比5%），规避自引风险。
高风险预警
1. 期刊稳定性：2025年中科院分区表将该刊列为「需重点关注期刊」（自引率接近预警线），建议投稿前通过「中科院文献情报中心小程序」查询最新预警状态。
2. 拒稿雷区：
- 代码未开源（近1年占拒稿原因的34%）；
- 方法学描述模糊（如未说明测序 depth/算法参数设置）；
- 讨论部分未引用本刊近2年综述（需至少引用1篇，如2024年《Deep learning applications in omics data analysis》）。
3. 费用陷阱：APC减免仅针对第一作者单位为低收入国家（如WHO分类的Low-Income Economies），中国作者需提供「科研经费不足证明」（需校级盖章），成功率约30%。
五、总结与工具包
核心总结
《Bioinformation》作为生物信息学领域的入门级OA期刊，以「低门槛、快发表、强实用性」为特色，适合工具类初稿、方法学预验证或硕士/初期科研人员积累成果。投稿时需重点关注代码开源、自引控制、数据可重复性三大核心要求，避开高风险雷区。
实用工具包
- 数据查询：
- JCR分区：科睿唯安Web of Science数据库（2025年6月后更新）；
- 自引率检测：SJR数据库（https://www.scimagojr.com）「Self-citations」模块。
- 投稿辅助：
- 代码开源：GitHub（提供DOI生成服务）+ Zenodo（永久存储）；
- 图表绘制：BioRender（生物信息学专用模板）、ggplot2（R包，期刊推荐可视化工具）；
- LaTeX模板：Overleaf「Bioinformation Article Template」（含算法伪代码环境）。
- 技术支持：期刊官网「Author Support」提供免费语言润色服务（限英文稿件，需在投稿信中注明「Request for language editing support」）。