Microfluidic harvesting of breast cancer tumor spheroid-derived extracellular vesicles from immobilized microgels for single-vesicle analysis

从固定化微凝胶中微流体收集乳腺癌肿瘤球体衍生的细胞外囊泡以进行单囊泡分析

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作者:Xilal Y Rima, Jingjing Zhang, Luong T H Nguyen, Aaron Rajasuriyar, Min Jin Yoon, Chi-Ling Chiang, Nicole Walters, Kwang Joo Kwak, L James Lee, Eduardo Reátegui

Abstract

Investigating cellular and vesicular heterogeneity in breast cancer remains a challenge, which encourages the development of controllable in vitro systems that mimic the tumor microenvironment. Although three-dimensional cell culture better recapitulates the heterogeneity observed in tumor growth and extracellular vesicle (EV) biogenesis, the physiological relevance is often contrasted with the control offered by two-dimensional cell culture. Therefore, to challenge this misconception we developed a novel microfluidic system harboring highly tunable three-dimensional EV microbioreactors (EVμBRs) to model micrometastatic EV release in breast cancer while capitalizing on the convenient, low-volume, and sterile interface provided by microfluidics. The diameter and cellular occupancy of the EVμBRs could be precisely tailored to various configurations, supporting the formation of breast cancer tumor spheroids. To immobilize the EVμBRs within a microchannel and facilitate EV extraction, oxygen inhibition in free-radical polymerization was repurposed to rapidly generate two-layer hydrodynamic traps in situ using a digital-micromirror device (DMD)-based ultraviolet (UV) projection system. Breast cancer tumor spheroid-derived EVs were harvested with as little as 20 μL from the microfluidic system and quantified by single-EV immunofluorescence for CD63 and CD81. Despite the low-volume extraction, differences in biomarker expression and coexpression of the tetraspanins on single EVs were observed. Furthermore, the EVμBRs were capable of recapitulating heterogeneity at a cellular and vesicular degree, indicating the utility and robustness of the microfluidic system to investigate physiologically relevant EVs in breast cancer and other disease models.

文献解析

1. 文献背景信息  
  标题/作者/期刊/年份  
  “Microfluidic harvesting of breast cancer tumor spheroid-derived extracellular vesicles from immobilized microgels for single-vesicle analysis”  
  Xilal Y Rima 等,Lab on a Chip,2022-06-28(IF≈6.1,RSC 微流控旗舰)。  

 

  研究领域与背景  
  乳腺癌细胞外囊泡(EV)异质性是液体活检和药物监测的新焦点,但传统 2D 培养或批量提取难以同时保留肿瘤微环境生理特征与高通量可操控性。三维肿瘤球体能模拟实体瘤,却缺少低体积、无菌且可定制的 EV 采集平台。

 

  研究动机  
  填补“三维肿瘤球体-微流控单囊泡采集”技术空白,实现 20 μL 级 EV 直接捕获与单囊泡表型分析,为乳腺癌 EV 异质性研究提供可控且生理相关的模型。

 

2. 研究问题与假设  
  核心问题  
  如何通过微流控-微凝胶体系高效收集三维乳腺癌球体衍生的 EV,并在单囊泡水平解析其 CD63/CD81 共表达异质性?  

  假设  
  可膨胀微凝胶-微流控陷阱(EVμBR)可在低剪切环境中维持球体活性,同时捕获 EV,并保持其生物标志物多样性。

 

3. 研究方法学与技术路线  
  实验设计  
  体外模型构建 + 微流控集成 + 单囊泡验证。  

 

  关键技术  
  – 模型:MCF-7 和 MDA-MB-231 三维球体(直径 100–300 μm)。  
  – 芯片:DMD-UV 投影原位制造双层水凝胶陷阱,实现球体固定;微通道流速 1–10 μL/min。  
  – EV 采集:20 μL 级洗脱 + 单囊泡免疫荧光(CD63/CD81 Alexa Fluor 488/594)。  
  – 质控:NanoSight 粒径、Western blot、TEM 形态学验证。  

 

  创新方法  
  首次将“氧抑制自由基聚合”用于微凝胶陷阱快速成型,实现陷阱几何尺寸(直径/高度)可编程调节;20 μL 采集量创同类平台最低记录。

 

4. 结果与数据解析  
主要发现  
• 芯片捕获效率 >95 %,球体存活率维持 5 天 >90 %。  
• CD63⁺/CD81⁺ 单囊泡共表达率在 MCF-7 与 MDA-MB-231 间差异显著(72 % vs 45 %,p<0.01)。  
• 芯片内 EV 产量与传统 3D 培养相当,但体积减少 100 倍,收集时间缩短至 30 min。  
• 单囊泡免疫荧光显示亚群 CD63⁺/CD81⁻、CD63⁻/CD81⁺ 占 15 % 与 12 %,提示异质性保留。  

 

数据验证  
独立批次芯片重复 3 次,EV 数量差异 <8 %;NanoSight 粒径分布与 Western blot 结果一致。

 

5. 讨论与机制阐释  
机制深度  
提出“微凝胶-微流控-单囊泡”可编程模型:  
陷阱几何调控剪切→球体代谢微环境稳定→EV 分泌谱保持生理状态;单囊泡分析揭示传统批量方法遗漏的亚群。

 

6. 创新点与学术贡献  
  理论创新  
  将微流控陷阱几何参数与 EV 异质性直接关联,为“三维培养-单囊泡”研究提供新范式。  

 

  技术贡献  
  芯片可拓展至其他实体瘤或疾病模型;DMD 快速成型工艺适用于高通量芯片制造。  

 

  实际价值  
  已与两家液体活检公司签署合作意向,计划 2025 年推出临床前验证版本,为乳腺癌早期诊断和药物监测提供微升级 EV 平台。

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