【文献解析】在批量、单细胞和空间转录组中绘制疾病进展过程中的关键瞬时基因互作
1. 领域背景与文献文献英文标题：Charting critical transient gene interactions in disease progression across bulk, single-cell, and spatial transcriptomics；发表期刊：Genome Biol；影响因子：未公开；研究领域：生物信息学，多模态转录组整合分析，疾病进展的基因调控网络研究。领域共识：近二十年来，转录组测序
【文献解析】空间转录组批次效应校正方法的系统基准研究
1. 领域背景与文献文献英文标题：A systematic benchmark of batch effect correction methods for spatial transcriptomics；发表期刊：Genome Biol；影响因子：未公开；研究领域：空间转录组生物信息学。领域共识：空间转录组技术近年来实现了快速发展，突破了传统批量转录组无法保留基因表达空间位置信息的局限，先后出现
【文献解析】深度学习整合单细胞与空间转录组揭示肺腺癌中性粒细胞相关间充质生态位及候选易位复合物依赖性
1. 领域背景与文献文献英文标题：Deep learning integration of single-cell and spatial transcriptomics reveals a neutrophil-associated mesenchymal niche and a candidate translocon dependency in lung adenocarcinoma；发表期刊：Cancer Immunol Immunother；影响因子：未公开；研究领域：肺腺癌肿瘤微环境，肿瘤生
【文献解析】空间转录组揭示三级淋巴结构内的细胞状态水平组织与趋化因子网络架构
1. 领域背景与文献文献英文标题：Spatial transcriptomics reveals cell state-level organization and chemokine network architecture within tertiary lymphoid structures；发表期刊：Cancer Immunol Immunother；影响因子：未公开；研究领域：肿瘤免疫微环境，三级淋巴结构空间组学研究。领域共识：三级淋巴结构（TLS）
空间转录组学工具或可建立肿瘤组织结构与治疗应答的关联
图片来源：Marcin Klapczynski/盖蒂图片社空间转录组学为癌症研究者提供了强有力的研究手段，不仅可明确肿瘤中激活基因的类型，还能定位基因活性的发生位置。但由于不同肿瘤微环境（tumor microenvironment, TME）在组成和功能上均存在异质性，不同肿瘤的空间转录组图谱很难进行跨样本比较。芝加哥大学研究人员近日报道了一
【文献解析】数据质量对基于组织学图像的空间转录组深度学习预测的影响
1. 领域背景与文献文献英文标题：Impact of data quality on deep learning prediction of spatial transcriptomics from histology images；发表期刊：Genome Biology；影响因子：未公开；研究领域：空间转录组学、深度学习、数字病理学交叉领域空间转录组学是2010年代兴起的前沿组学技术，2016年10x Genomics推出商业化空
【文献解析】实体瘤中空间组织化的调控性细胞死亡-免疫耦合：整合空间组学与可转化调控性细胞死亡生物学
1. 领域背景与文献文献英文标题：Spatially organized regulated cell death-immune coupling in solid tumors: integrating spatial omics with actionable regulated cell death biology；发表期刊：Molecular Cancer；影响因子：未公开；研究领域：肿瘤学（实体瘤免疫微环境与调控性细胞死亡的空间组学研究）肿瘤免疫治疗
空间转录组学揭示心脏移植排斥反应的异质性
图片来源：SergeyNivens/盖蒂图片社范德堡医学中心（Vanderbilt Health）与转化基因组学研究所（TGen）的研究团队采用基于图像的空间转录组学技术，解析了心脏移植排斥反应涉及的细胞程序，研究团队表示该分析可优化移植排斥的诊断、预测治疗应答，并对移植术后长期风险进行分层。这项题为《空间转录组学揭示人类心脏同种异
【文献解析】基于病理图像、单细胞测序及空间转录组数据鉴定乳腺癌亚型并探索关键亚型特异性基因的空间表达模式
1. 领域背景与文献文献英文标题：Identifying breast cancer subtypes and exploring spatial expression patterns of the key subtype-specific gene based on pathological images, single-cell sequencing, and spatial transcriptomic data；发表期刊：未公开；影响因子：未公开；研究领域：肿瘤学-乳腺癌精准医学与分子
【文献解析】宫颈癌空间转录组分析揭示微环境塑造的恶性上皮程序及ECM相关免疫生态位
1. 领域背景与文献文献英文标题：Spatial transcriptomics of cervical cancer reveals microenvironment shaped the malignant epithelial programs and ECM-associated immune niches；发表期刊：Cancer Immunol Immunother；影响因子：未公开；研究领域：肿瘤学-宫颈癌分子机制研究宫颈癌是全球女性发病率第四位的恶性肿