淋巴结被肿瘤"寄信"了?离心就看到

2026年10月26日浏览 0来源:本站

做肿瘤转移方向的朋友,肯定绕不开一个问题:肿瘤还没转移到淋巴结的时候,淋巴结里面到底发生了什么?常规思路是把淋巴结整个裂解了做 Western 或蛋白组,但这样一来,真正的主角——胞外蛋白——早就被大量胞内蛋白"淹没"了。今天这篇 STAR Protocols 给了个很聪明的做法:低速离心分离组织液(ISF)

做肿瘤转移方向的朋友,肯定绕不开一个问题:肿瘤还没转移到淋巴结的时候,淋巴结里面到底发生了什么?
常规思路是把淋巴结整个裂解了做 Western 或蛋白组,但这样一来,真正的主角——胞外蛋白——早就被大量胞内蛋白"淹没"了。
今天这篇 STAR Protocols 给了个很聪明的做法:低速离心分离组织液(ISF)
操作其实不难:完整组织放到 20μm 滤网上,加点 PBS,150×g 离心 10 分钟、4°C,组织液就被轻轻"挤"到管底了。
最妙的是
✅ 离心后细胞活力不变
✅ 组织结构完整(免疫荧光验证过)
✅ 剩下的组织还能接着做流式、免疫荧光、单细胞测序
等于一份样本,既拿到胞外蛋白组,又保留细胞层面的信息,一鱼两吃
产量参考:正常淋巴结 2–4 μL,肿瘤引流淋巴结 8–10 μL,500 mg 肿瘤约 50 μL——够上质谱了。
作者用的是小鼠乳腺癌模型(4T1 vs 67NR,转移 vs 非转移),从原位接种、取材,到酶解、DIA 质谱、DIA-NN 分析、火山图 UMAP 热图出图,全流程标准化。质谱数据在 PRIDE 开源,R 分析模板在 Zenodo 直接下载,复现门槛很低。
几个小提醒⚠️
· 淋巴结体积小,取样务必完整,血管碰破会很麻烦
· PBS 只加 10 μL,别多加,稀释了影响定量
· 高温天记得封口膜盖住滤网,防止蒸发
适合人群:肿瘤微环境、转移前龛(pre-metastatic niche)、淋巴结重塑方向的同学。做感染、免疫方向其实也能套用,患者来源淋巴结样本作者也验证过可行性。
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