DNA的正义和反义——是谁在指定？
DNA 是双螺旋，两条链是互补的。当细胞要读某个基因的时候，RNA 聚合酶必须决定：我该沿着哪条链走？往哪个方向走？它怎么知道的？
答案：启动子（promoter）
简单来说：在每个基因的起始位置上游（也就是基因编码区之前），都有一段叫做启动子的 DNA 序列。启动子的碱基排列有特定的模式——比如真核生物里最常见的是 TATA 盒，或者更普遍的 Pribnow 盒（TATAAT）。
RNA 聚合酶能特异性识别这些序列。当它看到启动子，就像一个人看到请在此排队的牌子：把自己附着在启动子上，启动子的碱基排列告诉它该朝哪个方向走，然后开始沿被指定的链合成 RNA。
基因在哪条链上？
答案是：两条链上都可能有基因！你的基因组里，有些基因在正义链上，有些在反义链上。甚至还有一种叫双向启动子的情况——一段启动子能同时给左右两边的基因指路。
总结
转录方向一错，合成出来的 RNA 就是反义 RNA——它和正常的 mRNA 互补配对，反而会抑制正常基因的表达。所以 RNA 聚合酶的方向选择对于基因表达的正确性至关重要。