一份瘤脑切片,同时做三种组学

2026年11月13日浏览 0来源:本站

研究儿童脑干胶质瘤(DMG)的同学都知道,这种肿瘤最难的点在于:长在脑桥、发生在婴幼儿时期,动物模型很难还原它真实的"发育土壤"今天分享的这篇 STAR Protocols 用了一个很聪明的思路——出生后第 3–5 天的乳鼠做脑桥原位注射,免疫健全、发育背景贴近真实发病年龄,成功率约 80%取瘤脑后心脏灌流清血 +

研究儿童脑干胶质瘤(DMG)的同学都知道,这种肿瘤最难的点在于:长在脑桥、发生在婴幼儿时期,动物模型很难还原它真实的"发育土壤"
今天分享的这篇 STAR Protocols 用了一个很聪明的思路——
出生后第 3–5 天的乳鼠做脑桥原位注射,免疫健全、发育背景贴近真实发病年龄,成功率约 80%
取瘤脑后心脏灌流清血 + 异戊烷速冻,RIN 能稳定在 7 以上,RNA 质量直接决定后面三种实验的成败
重点来了:从同一只鼠的相邻切片(间隔 10–30 μm)分别做:
① snRNA-seq:冷冻切片分离单核 + FANS 分选,一次上机 7000–10000 个核
② 10× Visium:空间转录组,3000–5000 个斑点落在组织上
③ 循环免疫荧光:多轮染色—成像—洗脱,验证蛋白层面
最贴心的是:cIF 全程用普通四通道荧光显微镜就能做,多轮图像对齐用作者开源的 Python 管线(CycFluoCoreg-STAR),不需要商用自动化设备
一个肿瘤、三个维度,转录组和蛋白组在同一张解剖坐标上直接对照。做肿瘤微环境、空间组学的朋友可以收藏慢慢看~
⚠️ 提醒:乳鼠立体定位操作难度不低,颅骨软、注射量要控制在 2 μL 以内,新手建议先在练习块上练手。
原文:Collot et al., STAR Protocols 2026(荷兰 Princess Máxima 儿童肿瘤中心,Rios 实验室),开放获取

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