图注：DNA与癌细胞 [Mohammed Haneefa Nizamudeen / iStock / Getty Images Plus]
微小残留病（minimal residual disease, MRD）仍是本届美国癌症研究协会（American Association for Cancer Research, AACR）年会的核心关注方向。治疗后体内残存的少量癌细胞可用于评估治疗效果与复发风险，对极微量残存癌细胞的检测能力，始终是癌症研究领域的核心攻关目标。
本届AACR年会上，测序企业Ultima Genomics公布了其利用ppmSeq技术在该领域取得的最新研究成果，相关数据将以6份摘要的形式发布，其中1份将在全会环节汇报。
本次公布内容的亮点为TRACERx（跟踪治疗下癌症演化，TRAcking Cancer Evolution through therapy (Rx)）MRD的初步研究数据，展示了ppmSeq相较于超灵敏定制检测Panel的性能优势。
TRACERx是由英国癌症研究中心资助的长期研究项目，也是全球规模最大的肿瘤演化研究之一，旨在解析癌症的演化、远处转移及治疗耐药的产生机制。研究人员未仅采集单次活检样本，而是对同一肿瘤及转移灶的不同区域分别采样，目前已完成800余例肺癌患者的3200余份肿瘤样本的多区域、多时间点基因测序分析。
该数据将由英国弗朗西斯·克里克研究所教授、皇家内科医师学会会员Charles Swanton（理学学士、博士）在全会环节汇报。他将公布ppmSeq在50份血浆样本中的初步验证试点结果：基于此前全基因组测序鉴定的肿瘤特异性变异，ppmSeq对低至个位数百万分比浓度的循环肿瘤DNA（circulating tumor DNA, ctDNA）可实现高分析灵敏度检测。
“TRACERx始终遵循癌症演化的科学规律开展研究，”Swanton表示，“提升ctDNA检测灵敏度是拓展MRD监测应用场景的核心，未来将研究覆盖至更广泛的患者群体，可提供足够的统计效力与临床证据，明确全基因组MRD监测如何在英国国家医疗服务体系（NHS）及更大范围内落地应用。”
会议同时将公布合作方的研究数据。Labcorp将公布与ppmSeq技术联合开发的检测方法的独立分析研究结果，涵盖术前未接受治疗的血浆样本中多种实体瘤的检测性能。对120份非癌症供体样本的分析显示，该检测的特异性超过99.9%，凸显ppmSeq全基因组测序可准确区分癌症与非癌症样本、显著降低假阳性的能力。针对涵盖0.5~500 ppm共13个浓度梯度的3种市售癌细胞系的补充分析显示，该检测的95%检测限低于3 ppm，证明其可检出超低水平ctDNA的性能。
“长期以来，行业始终存在疑问：无需复杂的定制检测方案，仅通过全基因组策略是否能实现真正超灵敏的MRD检测？”Ultima Genomics首席执行官Gilad Almogy博士表示，“本届AACR公布的这些数据给出了肯定答案。ppmSeq可达到所需的灵敏度水平，让全基因组MRD检测变得实用、可扩展，且更易于在全球范围内推广。”
专业注释
- 定制Panel：肿瘤基因检测中针对特定位点设计的基因捕获探针组合
- 检测限：检测方法可稳定检出的最低靶标浓度，反映检测灵敏度