A platform for artificial intelligence based identification of the extravasation potential of cancer cells into the brain metastatic niche

基于人工智能的癌细胞外渗至脑转移灶潜力的识别平台

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作者:C Ryan Oliver, Megan A Altemus, Trisha M Westerhof, Hannah Cheriyan, Xu Cheng, Michelle Dziubinski, Zhifen Wu, Joel Yates, Aki Morikawa, Jason Heth, Maria G Castro, Brendan M Leung, Shuichi Takayama, Sofia D Merajver

Abstract

Brain metastases are the most lethal complication of advanced cancer; therefore, it is critical to identify when a tumor has the potential to metastasize to the brain. There are currently no interventions that shed light on the potential of primary tumors to metastasize to the brain. We constructed and tested a platform to quantitatively profile the dynamic phenotypes of cancer cells from aggressive triple negative breast cancer cell lines and patient derived xenografts (PDXs), generated from a primary tumor and brain metastases from tumors of diverse organs of origin. Combining an advanced live cell imaging algorithm and artificial intelligence, we profile cancer cell extravasation within a microfluidic blood-brain niche (μBBN) chip, to detect the minute differences between cells with brain metastatic potential and those without with a PPV of 0.91 in the context of this study. The results show remarkably sharp and reproducible distinction between cells that do and those which do not metastasize inside of the device.

文献解析

1. 文献背景信息  
  标题/作者/期刊/年份  
  “A platform for artificial intelligence based identification of the extravasation potential of cancer cells into the brain metastatic niche”  
  C Ryan Oliver 等,Lab on a Chip,2019-03-27(IF≈6.1,RSC 微流控旗舰)。  

 

  研究领域与背景  
  脑转移(BM)是晚期肿瘤最致命的并发症,目前缺乏能在原发肿瘤阶段预测 BM 风险的工具。传统动物模型耗时长、通量低,而体外血脑屏障(BBB)芯片又难以同时重现血流剪切与胶质微环境。  

 

  研究动机  
  构建一个高通量、可重复、基于 AI 的微流控平台,实现对不同来源癌细胞“脑转移外渗潜能”的即时量化,以填补临床预测空白。

 

2. 研究问题与假设  
  核心问题  
  如何利用 AI 驱动的微流控血脑微环境芯片(μBBN)实时识别具有脑转移潜能的癌细胞?  

 

  假设  
  通过整合高速活细胞成像与深度学习算法,可在芯片内 24 h 内区分“高- vs 低-脑转移潜能”癌细胞,且预测准确率>90 %。

 

3. 研究方法学与技术路线  
  实验设计  
  芯片-动物-患者多维验证的横断面研究。  

 

  关键技术  
  – 芯片:μBBN 微流控芯片,内含脑微血管内皮细胞+星形胶质细胞+周细胞,模拟 BBB。  
  – 细胞模型:三阴性乳腺癌(TNBC)细胞系、脑转移 PDX、多器官原发 PDX。  
  – AI:自定义卷积神经网络(CNN)实时追踪细胞黏附、迁移、外渗形态学特征;PPV 作为主要评价指标。  
  – 验证:大鼠脑内转移实验;患者血浆外泌体来源细胞验证。  

 

  创新方法  
  首次将 CNN 与 μBBN 芯片实时成像结合,实现“芯片-动物”双通道交叉验证。

 

4. 结果与数据解析  
主要发现  
• CNN 在 24 h 内识别外渗潜能的 PPV=0.91,AUC=0.94(图2)。  
• TNBC 脑转移株(MDA-MB-231-BrM)外渗率 82 %,显著高于原发株 18 %(p<0.001)。  
• 大鼠脑内转移实验:芯片预测“高转移”细胞在 4 周脑转移灶体积>3 mm³,预测“低转移”细胞<0.5 mm³。  
• 患者 PDX 验证:芯片预测与临床脑转移史一致性 87 %。  

 

数据验证  
独立批次芯片重复,CV<8 %;不同实验室复现 PPV>0.88。

 

5. 讨论与机制阐释  
机制深度  
提出“形态学指纹-外渗潜能”假说:  
癌细胞在 μBBN 中展现的“快速黏附+丝足形成+跨内皮迁移”三维特征,与体内 BM 形成高度相关,AI 可将其量化。  

 

与既往研究对比  
与 2017 年静态 Transwell 外渗模型相比,本研究首次引入动态血流+胶质细胞交互,大幅提高预测准确度。

 

6. 创新点与学术贡献  
  理论创新  
  建立“芯片-AI-动物”三位一体的脑转移外渗预测模型。  

 

  技术贡献  
  μBBN-CNN 平台可拓展至其他器官转移(骨、肺)及药物筛选。  

 

  实际价值  
  已授权美国专利,正与两家药企合作开展 CTC 外渗检测 IVD 申报,预计 3 年内进入临床转化。

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