（左至右）Incyte总裁兼全球研发负责人Pablo J. Cagnoni医学博士，Genesis Molecular AI创始人兼首席执行官Evan Feinberg博士。Incyte与Genesis已扩展双方基于AI的药物合作，覆盖至少5个靶点，Genesis可获得的潜在总收益已飙升至10亿美元以上。[图片来源：Incyte与Genesis Molecular AI]
药物合作并非总能按计划推进，有时其进展甚至会超出预期。
去年Incyte与人工智能（AI）平台开发商Genesis Molecular AI达成合作，共同研究、发现并开发至少2款小分子治疗药物，当时双方约定Genesis可获得最高6.2亿美元的合作收益。Genesis的分子AI大模型旨在赋能智能药物设计与开发。
目前两家公司表示，过去15个月的合作已取得充足进展，因此将基于AI的药物合作扩展至至少5个靶点，Genesis可获得的潜在收益随之升至10亿美元以上。
双方表示，本次合作扩展的动因是最初2个靶点目前已展现出良好前景，这两个靶点均是按照最初战略合作协议的要求由Incyte选定的。Incyte总裁兼全球研发负责人Pablo J. Cagnoni医学博士向《GEN》透露：其中一个是“极难成药的全新靶点”，双方正针对该靶点开发首创性（first-in-class）全新化学分子；另一个靶点则是此前多家企业尝试成药均未成功的靶点。
“全新靶点的研发难点是显而易见的：你没有任何已知的起始化学分子。与Genesis的合作极大地推动了该项目的进展，”Cagnoni在谈及第一个靶点时表示，“你需要获得晶体结构，明确需要结合的靶点特定位点，之后才能开始合成针对该位点的化学物质。”
Cagnoni补充道：“合成化学分子很容易，但开发成药物却极为困难——而Genesis恰恰在这一优化步骤上为我们提供了极大帮助。”
他解释称，第二个靶点不仅要求药物具备高亲和力与极高选择性，还需要拥有独特的药学与药代动力学特性。借助Genesis的生成与预测AI平台分子空间探索系统（Genesis Exploration of Molecular Space, GEMS），双方成功为该靶点的候选分子整合了上述及其他所需特性。
GEMS将AI与物理学整合到模型中，用于生成和优化药物分子。其用于结构预测的生成扩散模型Pearl（全称为“将每个原子置于正确位置”）于2025年10月26日发布在预印本平台上，结果显示，在公开蛋白-配体共折叠基准测试Runs N" Poses上，其表现优于AlphaFold 3及其他开源基线模型（性能提升14.5%）；在分子对接与生成基准测试PoseBusters上，性能提升14.2%。
“实质性进展”
Cagnoni表示：“借助GEMS平台与Genesis团队的支持，我们能够同时优化多个参数，取得了使用其他技术无法实现的实质性进展。与Genesis的合作让我们在向研究性新药（IND）申报推进的道路上取得了显著进展，虽然尚未达到申报节点，但我们已经非常接近了。”
他指出，这两个靶点代表了药物发现谱系的两端：“其中一个靶点我们已经有了类药分子，但性能还不够好；另一个靶点成药价值很高，但没有任何先导药物。基于对这两个极端场景的验证，我确信我们需要扩展合作，尽可能扩大合作范围，这也是我们达成新合作协议的原因。”
与最初的合作一致，双方目前尚未披露合作靶点或所属治疗领域，但Cagnoni表示，这些靶点均属于Incyte当前三大关注的治疗领域之一：血液学、肿瘤学，以及炎症与自身免疫（属于传统炎症与免疫学（I&I）领域下的细分方向）。
通过本次扩展合作，Incyte将使用其专有的实验数据训练Genesis的GEMS平台，旨在加速多个项目的药物开发进程。
5个靶点之外的合作选择权
Incyte将至少选择5个新靶点与Genesis共同开发，并有权在后续新增合作靶点。Incyte将拥有合作开发的治疗药物的独家开发与商业化权益。
Feinberg表示：“我们预先就知道需要优化哪些特性，但总会存在一些不确定因素。我们几乎始终需要实现药物的亲和力、选择性，以及各类吸收、分布、代谢、排泄（ADME）特性。通常在一个项目中，需要常规开展约30种不同的ADME检测，频次各有不同。这个过程通常像是打地鼠游戏，而非多参数优化的严谨工程化任务。”
他补充道：“我们的目标是让药物发现过程尽可能贴近后者，远离前者。”
Incyte已同意向Genesis支付1.2亿美元的首付款，其中包括8000万美元现金与4000万美元的Genesis股权收购款，同时还将支付未披露金额的持续性研究经费，用于支持AI模型训练与推理计算。此外，Incyte还将为每个靶点向Genesis支付最高2.32亿美元的款项，与临床前及临床开发、监管、销售里程碑的达成挂钩。
本次合作是Incyte在5月底宣布的第二项聚焦AI的合作。在宣布扩展与Genesis合作的前一天，Incyte宣布已与Edison Scientific达成另一项战略合作，将使用其Kosmos AI平台开展发现与开发工作——具体而言是实现从转化与临床数据的持续学习、证据的实时整合，以及治疗效果预测模型的构建。
Incyte与Edison披露了其初始项目的重点：靶点发现与验证、转化生物学领域的“高影响力”应用场景，Edison的AI能力将嵌入Incyte的研究工作流中。双方表示，其目标是支持更高效地挖掘实验、临床与生物标志物数据，未来有可能拓展至Incyte更广泛的研发体系中。
至于Incyte与Genesis的合作，如果Genesis在扩展合作的5个初始靶点上实现所有里程碑（包括多个适应症与主要市场），且5款产品的累计年度最高净销售额达到指定里程碑，Incyte将向其支付超过10亿美元。根据后续新增的合作靶点数量及达成的里程碑数量，付款总额可能增长至数十亿美元。
Genesis还将有权获得任何获批合作产品的销售提成。
斯坦福大学孵化企业
Genesis于2019年从斯坦福大学Vijay Pande博士的实验室孵化成立，Pande博士是风险投资公司VZVC的联合创始人兼管理合伙人，此前曾是安德森·霍洛维茨基金（a16z）的普通合伙人，也是a16z生物基金的创始普通合伙人。Feinberg曾是Pande实验室的研究生，是深度学习技术相关关键同行评议论文的共同发明者与共同作者。
2020年，Genesis获得5200万美元的A轮融资。截至目前，该公司累计融资额已达3.4亿美元，其中大部分来自3年后完成的2亿美元B轮融资，以及本次扩展合作中Incyte对Genesis的4000万美元战略股权投资。
除a16z外，Genesis的投资方还包括AI芯片巨头英伟达的风险投资部门NVentures，后者近年来已将投资范围拓展至生物制药等多个行业。
Incyte是第四家、也是最新一家与Genesis达成基于GEMS平台的AI药物发现与开发合作的生物制药巨头。Genesis在2024年启动与吉利德科学的合作时获得了3500万美元的首付款，此前还曾宣布与礼来、罗氏集团成员基因泰克达成过合作。
Genesis创始人兼首席执行官Evan Feinberg博士向《GEN》表示：“Genesis的使命是开发AI技术，助力研发原本不可能实现的药物。通过与Incyte这样的顶尖药物发现团队合作，我们能够解决药物发现领域各类极为重要的问题。”
他表示，这项工作需要识别每个潜在靶点的独特性。
Feinberg指出：“从某种程度上来说，每个靶点都是独一无二的‘特殊雪花’。每个药物靶点都有其自身的挑战，往往需要采用专属的特殊方法。过去一年，我们开展了两个差异极大的项目，各自都面临不同的挑战，这也让我们能够在完全不同的场景中调整并部署GEMS AI平台，其中一个靶点已经非常接近IND申报，另一个靶点则发现了首创性化学分子，这一年的工作成果令人非常振奋。”
“现在我们非常期待通过本次扩展合作，共同应对未来的挑战。”Feinberg补充道。
专业注释
- 首创性（first-in-class）：靶向全新作用机制的首款候选药物
- 研究性新药（IND）：药物进入临床试验前需提交的监管申请
- 吸收、分布、代谢、排泄（ADME）：药物体内过程的核心评价指标
勘误
原文倒数第二段“Feniberg”为拼写错误，应为“Feinberg”。