1. 领域背景与文献引入
文献英文标题:Cancer metabolites: promising biomarkers for cancer liquid biopsy;发表期刊:Biomarker Research;影响因子:未公开;研究领域:肿瘤代谢组学与液体活检生物标志物研究。
癌症是全球100多个国家的主要死亡原因之一,2021年全球新增1929万例癌症病例,死亡996万例。代谢重编程是癌症的核心特征之一,肿瘤细胞通过重构代谢通路(如糖酵解、脂质合成、氨基酸代谢)满足无限增殖的能量和生物合成需求,伴随异常代谢物的积累。代谢组学作为系统研究生物样本中所有代谢物的学科,位于基因组、转录组、蛋白质组下游,直接反映个体的生理和病理状态,因此成为发现癌症生物标志物的重要工具。
传统肿瘤活检依赖组织样本,存在侵入性、无法动态监测、难以获取等局限;而液体活检(如血液、尿液、唾液等)通过非侵入方式获取样本,可实时反映肿瘤状态。代谢物作为代谢重编程的直接产物,具有“动态、敏感、易检测”的优势,成为液体活检的潜在生物标志物。然而,当前癌症代谢物研究仍面临“代谢物异质性大、解读困难、缺乏统一检测标准”等问题。
本综述系统总结了近十年报道的异常癌症代谢物,梳理了代谢组学在液体活检中的应用(样本类型、技术方法、数据分析)及挑战,旨在为癌症代谢物的临床转化提供理论支撑。
2. 文献综述解析
2.1 核心评述逻辑
综述以“代谢途径分类”为核心维度,将癌症代谢物分为糖代谢、脂质代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢及其他(维生素、肠道微生物、外泌体相关代谢物)五大类,逐一阐述各类代谢物的异常变化、功能机制及作为生物标志物的潜力;同时围绕“液体活检”需求,讨论代谢组学技术(核磁共振、质谱)、数据分析方法(统计模型、机器学习)的应用现状,最后指出当前研究的局限与未来方向。
2.2 现有研究总结
(1)关键结论
- 糖代谢:癌代谢物(如2-羟基戊二酸、琥珀酸、延胡索酸)由IDH、FH、SDH基因突变产生,可抑制表观遗传酶、促进肿瘤生长,其组织水平与患者无进展生存(PFS)、总生存(OS)相关;乳酸作为糖酵解产物,参与肿瘤微环境酸化、脂质合成及基因表达调控,与肝癌 ferroptosis 耐药相关。
- 脂质代谢:游离脂肪酸(如花生四烯酸、亚油酸)、胆固醇代谢物(如27-羟基胆固醇)与肺癌、乳腺癌进展相关,血清多不饱和脂肪酸对癌症早期诊断具有高敏感性;磷脂重编程(如磷脂酰胆碱、溶血磷脂酰胆碱)与多种癌症的诊断、预后密切相关。
- 氨基酸代谢:谷氨酰胺、丝氨酸、支链氨基酸(BCAAs)是肿瘤增殖的必需底物,其代谢水平与药物耐药、生存预后相关;色氨酸代谢物(如犬尿氨酸)可作为癌症风险生物标志物,IL4I1酶催化的色氨酸代谢通路为治疗提供新靶点。
- 核苷酸代谢:嘌呤、嘧啶代谢异常为肿瘤提供能量和核酸原料,胸腺苷酸合成酶(TS)缺陷可抑制肿瘤转移,5-甲基胞嘧啶(m5C)修饰模式与卵巢癌生存差异相关。
- 其他代谢物:维生素B3衍生物(NAM)通过调节脂质代谢和免疫逃逸参与乳腺癌进展;肠道微生物相关血清代谢物(GMSM)可区分结直肠癌(CRC)与腺瘤;外泌体代谢物(如HSPC111)通过重构癌相关成纤维细胞(CAFs)脂质代谢促进CRC肝转移。
(2)方法优势与局限
- 优势:代谢组学技术(如NMR、LC-MS)具有高灵敏度和特异性,可检测低丰度代谢物;液体活检样本(如血液)易获取、可重复采样,能动态反映肿瘤状态。
- 局限:代谢物异质性大(受肿瘤基因型、组织来源、微环境影响);代谢组学数据解读困难(缺乏代谢物-疾病机制的明确关联);检测方法缺乏标准化(不同平台的定性定量结果差异大)。
2.3 综述创新价值
本综述的核心创新在于“系统分类+临床导向”:一方面按代谢途径系统总结了不同类型的癌症代谢物,明确其功能机制与生物标志物潜力;另一方面聚焦液体活检需求,整合了代谢组学技术、数据分析及临床验证的全流程,强调了“多组学整合(代谢组+基因组/蛋白质组/微生物组)”对解决代谢物异质性、解读困难的关键作用,为癌症代谢物的临床应用提供了清晰框架。
3. 研究思路总结与详细解析
3.1 整体框架
综述遵循“背景→分类论述→应用→挑战”的闭环逻辑:
1. 背景:阐述癌症代谢重编程的重要性、代谢组学的下游特性及液体活检的需求;
2. 分类论述:按代谢途径逐一讨论异常代谢物的功能与生物标志物潜力;
3. 应用:梳理代谢组学在液体活检中的样本类型(血液、尿液、唾液等)、技术方法(NMR、MS联用)及数据分析(统计模型、机器学习);
4. 挑战与展望:指出当前研究的局限(方法不统一、异质性、外界因素影响),提出多组学整合、标准化方法开发等解决方向。
3.2 关键环节解析
3.2.1 代谢途径分类论述
实验目的:明确不同代谢途径的癌症代谢物异常及功能机制。
方法细节:通过“文献检索+系统综述”方法,纳入近十年关于癌症代谢物的研究,按代谢途径分类整理;结合功能实验(如基因敲除、代谢通量分析)验证代谢物的促癌机制。
结果解读:各类代谢物的异常变化与肿瘤进展(增殖、转移、耐药)直接相关,其水平可作为诊断、预后的生物标志物(如CRC的GMSM、NSCLC的花生四烯酸)。
产品关联:文献未提及具体实验产品,领域常规使用核磁共振(NMR)、液相色谱-质谱联用(LC-MS)、气相色谱-质谱联用(GC-MS)等技术,以及MetaboAnalyst、XCMS等数据分析工具。
3.2.2 液体活检应用分析
实验目的:评估代谢组学在液体活检中的可行性与有效性。
方法细节:总结临床研究中液体活检样本(血液、尿液、唾液等)的应用,对比不同代谢组学技术(靶向vs非靶向)的优缺点;分析数据分析方法(如PCA、PLS-DA、随机森林)对生物标志物筛选的作用。
结果解读:血液是最常用的液体活检样本(易获取、符合临床常规),质谱联用技术(如LC-MS)具有高分辨率,可检测低丰度代谢物;机器学习模型(如随机森林)能提高生物标志物的分类准确性(如膀胱癌的代谢组学模型)。
产品关联:文献未提及具体实验产品,领域常规使用Thermo Fisher的LC-MS系统、Bruker的NMR仪等设备。
3.2.3 挑战与展望
实验目的:明确癌症代谢物临床转化的障碍与解决方向。
方法细节:基于现有研究的局限(如方法不统一、异质性),结合多组学整合(代谢组+基因组、蛋白质组)、大样本队列研究的最新进展,提出未来研究方向。
结果解读:代谢物的异质性(肿瘤基因型、组织来源)、外界因素(饮食、药物)及方法标准化是主要挑战;多组学整合可揭示代谢物的上游调控机制(如代谢组+蛋白质组解析三阴性乳腺癌的铜代谢-转移轴),标准化方法(如Metabolomics Standards Initiative)可提高数据可比性。
4. Biomarker 研究及发现成果解析
4.1 Biomarker 定位与筛选逻辑
综述涉及的Biomarker类型包括代谢途径特异性代谢物(如2-羟基戊二酸、花生四烯酸)、肠道微生物相关代谢物(GMSM)、外泌体代谢物三大类。筛选逻辑遵循“组学筛选→临床验证→机制解析”:
1. 组学筛选:通过非靶向代谢组学(如LC-MS)分析肿瘤与正常样本的代谢差异,结合宏基因组(如粪便16S测序)筛选肠道微生物相关代谢物;
2. 临床验证:利用靶向代谢组学(如MRM模式)在独立队列中验证差异代谢物的特异性与敏感性;
3. 机制解析:通过功能实验(如基因编辑、代谢通量分析)明确代谢物的促癌机制(如2-羟基戊二酸抑制DNA修复)。
4.2 研究过程详述
(1)样本来源
主要为液体活检样本:血液(最常用,如CRC的血清GMSM、肺癌的血浆脂肪酸)、尿液(如膀胱癌的代谢标志物)、唾液(如口腔癌)、房水(如视网膜母细胞瘤)。
(2)验证方法
- 检测技术:核磁共振(NMR)用于代谢指纹分析,质谱联用技术(LC-MS、GC-MS)用于高分辨率定性定量;
- 数据分析:单变量统计(t检验、ANOVA)筛选差异代谢物,多变量统计(PCA、PLS-DA)降维分析,机器学习(随机森林、SVM)构建分类模型;
- 临床验证:通过回顾性/前瞻性队列验证代谢物的诊断性能(如CRC的GMSM在验证队列中的AUC=0.92)。
(3)特异性与敏感性数据
- CRC的肠道微生物相关代谢物:8种GMSM组合的AUC=0.92,敏感性83.5%,特异性84.9%,可区分CRC与腺瘤;
- NSCLC的血浆脂肪酸:花生四烯酸、亚油酸对NSCLC的早期诊断具有高敏感性(文献未提及具体数值,但强调其特异性);
- 胶质瘤的IDH突变代谢物:2-羟基戊二酸的组织水平与患者OS相关(风险比HR未提及,但明确其预后价值)。
4.3 核心成果提炼
- 早期诊断:CRC的GMSM、NSCLC的脂肪酸代谢物可作为早期筛查生物标志物,非侵入性检测提高患者依从性;
- 预后评估:IDH突变相关代谢物(2-羟基戊二酸)、TS基因表达与胶质瘤、结肠癌的生存预后相关;
- 治疗监测:谷氨酰胺代谢物与靶向治疗(如EGFR-TKI)耐药相关,可用于预测治疗反应;
- 创新性:首次系统总结了肠道微生物代谢物、外泌体代谢物作为液体活检生物标志物的潜力,提出“多组学整合”是解决代谢物异质性的关键策略(如代谢组+宏基因组解析肠道微生物-代谢物-癌症的关联)。
总结
本综述系统梳理了癌症代谢物的研究现状,强调了代谢组学在液体活检中的优势与挑战。其核心贡献在于将代谢途径与液体活检需求结合,为癌症代谢物的临床转化提供了“分类-筛选-验证”的清晰框架。未来研究需聚焦方法标准化、多组学整合及大样本队列验证,推动癌症代谢物成为液体活检的“新型生物标志物”。
