无内毒素人源重组 Tau 蛋白的高效纯化方案
Protocol for efficient purification of endotoxin-free human recombinant tau protein
Maria Kreger Karabova, Ana del Ser-Badia, William S. James, Sally A. Cowley(牛津大学 Sir William Dunn 病理学系 · James and Lillian Martin 干细胞研究中心)
STAR Protocols · 2026-08-27 · DOI: 10.1016/j.xpro.2026.104800 · PMC13546840 · 质粒已存 Addgene(Cat#249347)
一句话背景
研究小胶质细胞对 tau 蛋白的应答时,最大陷阱是内毒素(LPS)污染:大肠杆菌表达体系里的 LPS 一旦释放,会靠强静电作用牢牢"挂"在净正电荷的 tau 上,哪怕痕量也能通过 CD14–TLR4–MD2 通路引爆小胶质细胞的炎症反应,让实验结果分不清是 tau 的效应还是内毒素的干扰。这个方案把去内毒素直接整合进纯化流程,在镍柱上用 Triton X-114 原位洗脱内毒素,最终产物在 1 μg/mL 工作浓度下内毒素 ≤0.01 EU/mL。
方案亮点(Innovation)
- 柱上除热原:Ni-NTA 捕获蛋白后,立即用含 0.1% Triton X-114 的缓冲液在柱上洗涤(≥50 个柱体积),利用 Triton X-114 的相分离特性把内毒素从 tau 上解离带走——比纯化后反复去垢剂萃取更省力、回收率更高;
- 6xHis-SUMO3 标签 + SENP2 酶切:SUMO3 减少蛋白水解降解,SENP2 切割得到天然 N 端 tau,避免 TEV 酶切残留额外氨基酸;
- CIEX 阳离子交换 + 高容量除内毒素树脂双重保险:进一步提纯并清除残留内毒素;
- 附带肝素诱导聚合流程:4:1 tau:heparin 摩尔比、37°C 振荡 11 天产出可播种 tau 原纤维(PFF),TEM + FRET 生物传感器双重验证;
- 流程可推广到其他 tau 亚型及其他净正电荷、易染内毒素的重组蛋白。
关键资源表(节选)
| 类别 | 名称 | 来源 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 菌株 | BL21(DE3) 感受态细胞 | Thermo Fisher | EC0114 |
| 质粒 | pETM11-Sumo3-TauWT2N4R | Addgene | 249347 |
| 酶 | SENP2 蛋白酶 | Leadgene | LDG0015RG |
| 试剂 | Triton X-114 | Sigma-Aldrich | X114 |
| 试剂 | 肝素(Heparin) | Sigma-Aldrich | H3393 |
| 试剂 | 注射用水(WFI) | Thermo Fisher | A1287301 |
| 试剂盒 | BCA 蛋白定量(耐还原剂) | Thermo Fisher | 23250 |
| 试剂盒 | 高容量除内毒素 Spin 柱 0.5 mL | Thermo Fisher | 88274 |
| 试剂盒 | LAL 显色法内毒素定量 | Thermo Fisher | A39553 |
| 层析柱 | HisTrap HP 5 mL | Cytiva | 17524802 |
| 层析柱 | HiTrap Capto S 5 mL | Cytiva | 17544123 |
| 细胞系 | Tau RD P301S FRET Biosensor | ATCC | CRL-3275 |
| 耗材 | SnakeSkin 透析袋 3.5 kDa MWCO | Thermo Fisher | 68035 |
| 耗材 | PES 蛋白浓缩器 10K MWCO 5–20 mL | Thermo Fisher | 88528 |
| 仪器 | ÄKTA Pure 25M / EmulsiFlex-C5 高压匀浆器 | Cytiva / Avestin | — |
完整清单见原文 Key Resources Table。另需 LC-MS 平台(或送质谱核心 facility)在下游应用前核实蛋白分子量与纯度。⚠️ 所有纯化储液/缓冲液 4°C 配制、调 pH、保存;纯化缓冲液当天现配;0.2 μm 抽滤除菌并 4°C 脱气。BME 有毒易燃,通风橱内操作;咪唑有腐蚀性和生殖毒性。
试剂配方(按 3 L 菌液规模)
① Tau 表达
| 溶液 | 组成 | 备注 |
|---|---|---|
| TB 基液(2.7 L) | Tryptone 13.3 g/L(36 g)+ Yeast extract 26.7 g/L(72 g)+ 甘油 0.44%(12 mL) | 900 mL/2 L 瓶 ×3,高压灭菌,提前一天配 |
| 10× TB 盐(1 L) | KH₂PO₄ 0.17 M(23.1 g)+ K₂HPO₄ 0.72 M(125.4 g) | 高压灭菌,提前一天配 |
| IPTG(100 mM,40 mL) | IPTG 0.952 g 溶 ddH₂O | 现配现用,冰上 |
② Tau 纯化缓冲液
| 缓冲液 | 组成 | pH(4°C) |
|---|---|---|
| HEPES 储液(1 M) | 238.3 g/L,每轮纯化现配 | 7.6(10 M NaOH) |
| NaCl 储液(2 M) | 116.88 g/L | 密封 4°C 长期保存 |
| 咪唑储液(1 M) | 68.08 g/L | 密封避光 4°C |
| 裂解液(500 mL) | 25 mM HEPES + 150 mM NaCl + 10 mM 咪唑 + 1 mM TCEP + DNase I 1.68 U/mL(5 μL)+ 蛋白酶抑制剂 1 片 | 7.6(37% HCl),用前抽滤 |
| HisTrap A1(1 L) | 25 mM HEPES + 150 mM NaCl + 10 mM 咪唑 + 1 mM TCEP + 抑制剂 2 片 | 7.6,脱气抽滤 |
| HisTrap A2(500 mL,除内毒素洗柱液) | 同 A1(抑制剂 1 片)+ 0.1% Triton X-114(500 μL) | 7.6;过滤后再加 Triton,4°C 轻柔搅匀勿起泡 |
| HisTrap B(500 mL,洗脱) | 25 mM HEPES + 150 mM NaCl + 500 mM 咪唑 + 1 mM TCEP | 7.6,脱气抽滤 |
| 透析缓冲液(4.5 L) | 25 mM HEPES + 100 mM NaCl + 5 mM BME(1.6 mL) | 7.6(10 M NaOH) |
| Rebind C(1 L) | 25 mM HEPES + 100 mM NaCl + 10 mM 咪唑 + 5 mM BME | 7.1,脱气抽滤 |
| Rebind D(500 mL) | 25 mM HEPES + 100 mM NaCl + 500 mM 咪唑 + 5 mM BME | 7.1 |
| CIEX E(1 L) | 25 mM HEPES + 100 mM NaCl + 5 mM BME | 7.1 |
| CIEX F(500 mL) | 25 mM HEPES + 1 M NaCl + 5 mM BME | 7.1 |
③ 残留内毒素去除(生物安全柜内、当天现配,均 0.22 μm 过滤)
| 溶液 | 组成 |
|---|---|
| 再生缓冲液(25 mL) | 0.2 N NaOH(0.2 g)+ 95% 乙醇(23.75 mL)+ WFI(1.25 mL) |
| NaCl 储液(25 mL) | 2 M(2.922 g)+ WFI |
| 无内毒素缓冲液(25 mL) | 30 mM Tris-HCl(0.118 g)+ 0.2 M NaCl(2.5 mL)+ WFI;pH 试纸测 pH,0.1 M NaOH 调至 6–8 |
④ 肝素诱导聚合
肝素储液(700 μM,1 mL):12.6 mg 溶于 WFI,0.22 μm 过滤,现配现用。⚠️ 肝素分子量批间波动(通常 15–19 kDa),按实际分子量换算用量;原文批次为 18 kDa。
分步方案
第一阶段:大肠杆菌表达(3 天)
- 转化 BL21(DE3):感受态冰上融 15 min → 15 ng 质粒加入 50 μL 菌悬液,轻弹混匀(勿涡旋)→ 冰上 30 min → 42°C 热激 30 s → 回冰 5 min → 加 450 μL S.O.C.,37°C 180 rpm 复苏 1 h → 涂 50 μL 于含 50 μg/mL 卡那霉素 LB 平板,37°C 14–16 h。⏸ 平板可 4°C 存,但表达建议用新鲜克隆。
- 种子菌:挑单克隆入 40 mL LB + 卡那霉素(250 mL 瓶),共 3 瓶;37°C、180 rpm 培养 14–16 h。此时可留甘油菌(菌液:50% 甘油 = 1:1,−80°C 存 5 年)。
- 扩大培养:每种子菌转入 900 mL TB + 100 mL 10× TB 盐 + 卡那霉素的 2 L 瓶,37°C、200 rpm 培养。
- 诱导:每 30 min 测 OD600,达 0.5–0.7(约 2–3 h)时加 5 mL 100 mM IPTG(终 0.5 mM)。先 37°C、225 rpm 诱导 1 h,再 25°C、200 rpm 继续 14–16 h。
- 收菌:5,000 ×g、4°C 离心 30 min。来不及离心可冰上暂放数小时,切勿冷冻。每升原菌液沉淀用 25 mL 新鲜预冷裂解液重悬——务必彻底无团块(防堵匀浆器),全程冰上。⏸ 重悬后菌体 −80°C 可存 4 周,或步骤澄清后再存——两个暂停点只能选其一。
第二阶段:细菌裂解(4–5 h)
- 菌悬液冰上融化;French Press 匀浆:15 kpsi,4–5 个循环至完全破碎(4°C 循环水保温;小规模可超声)。
- 裂解液入 50 mL LoBind 管,4,500 ×g、4°C 离心 1 h 去碎片;上清转入新管。⏸ 上清可 −80°C 存 1 周。
- 热变性除杂:70°C 水浴 10 min(先稍松盖防胀压),室温冷却 10–15 min;再次 4,500 ×g、4°C 离心 1 h。
- 上清经 0.45 μm 滤器过滤合并,置冰上进 IMAC;留 20 μL 做 SDS-PAGE。
第三阶段:无内毒素纯化(2 天,全程 4°C)
(A)IMAC + 柱上 Triton X-114 除内毒素(HisTrap HP 5 mL,5 mL/min)
- 5 CV ddH₂O 洗柱 → 5 CV A1 平衡 → 上样(约 100–150 mL;无空气传感器务必固定上样体积)→ 留 20 μL 流穿 → ≥50 CV A2(0.1% Triton X-114)洗柱(除内毒素关键步骤) → 20 CV A1 洗去残留去垢剂 → 0–100% B 线性梯度 33 CV + 100% B 6 CV,5 mL/管收集 → 清洗封柱(每 2–3 次用 60 CV 1 M NaOH 深度清洗)。
- SDS-PAGE(8%–16% Tris-Glycine + SimplyBlue):融合蛋白(约 75 kDa)主要在 10–16 管。合并含 tau 峰管。省时技巧:染液微波高火 20–30 s(勿沸腾)再摇 15 min。
- 粗测浓度:按洗脱梯度算合并液平均咪唑浓度(原文示例 181.8 mM),用 B 液配同浓度咪唑空白,NanoDrop 粗测;预期 1–1.1 mg/mL(可用 Bradford 替代)。
(B)SENP2 切标签 + 过夜透析
- 按 SENP2:tau = 1:100(w/w)加 SENP2(厂商推荐 1:50,实测 1:100 已切透),冰上轻柔混匀。
- 切标签与透析同步过夜:SnakeSkin 透析袋(3.5 kDa)剪约 1 cm/mL + 余量,ddH₂O 泡 10–15 min;灌入混合液(留 0.5 cm 顶部空间)两端夹紧;放入 4.5 L 透析缓冲液(约 100 倍样品体积);⚠️ 系浮漂防搅拌子搅破袋子;铝箔避光 4°C 缓慢搅拌过夜。
- IMAC rebind(换专用柱)去未切蛋白与残余 SENP2:5 CV ddH₂O → 5 CV Rebind C 平衡 → 上样约 35 mL → 收流穿(切后 tau 理论上在此)→ 10 CV C 洗柱 → 0–20% D 梯度 30 CV + 45% D 5 CV + 100% D 5 CV,5 mL/管。???? 实践中部分切后 tau 会非特异吸附在柱上(低盐 + tau 固有无序特性),必须用咪唑梯度回收。合并含 tau 峰管(约 55–60 kDa,原文 34–43 管)。
- 用 CIEX E 稀释合并液,把咪唑降到 15–30 mM——决定 tau 能否结合 CIEX 柱的平衡点(太高不结合、稀释太狠上样时间暴增)。
(C)CIEX 阳离子交换(HiTrap Capto S 5 mL,5 mL/min)
- 5 CV ddH₂O → 5 CV E 平衡 → 上样 → 收流穿 → 6 CV E 洗柱 → 0–100% F 梯度 30 CV + 100% F 5 CV,5 mL/管 → 清洗封柱。???? 原理:2N4R tau 理论 pI ≈8.2,pH 7.1 下带净正电,结合带负电树脂。
- SDS-PAGE 后合并含 tau 单体峰管(约 60 kDa),留 20 μL。⏸ 可 4°C 存过夜。
第四阶段:浓缩、残留内毒素去除与质检(1–2 天)
- 浓缩:10K MWCO PES 浓缩器 ×3(50 mL 均分),4,000 ×g、4°C,浓缩至 2–3 mL(约 30–45 min)。⚠️ 勿过度浓缩——体积太小时 tau 聚集或粘膜;膜用 0.5–1 mL 洗脱液冲洗并回收入样(终约 2–2.5 mL)。
- 残留内毒素去除(安全柜内):Pierce 高容量除内毒素 Spin 柱——树脂用 3.5 mL 0.2 N NaOH/95% 乙醇室温滚轴再生 2 h → 与浓缩 tau 室温滚轴共孵育 2 h(比厂商推荐更久)→ 500 ×g 离心 1 min 收样(约 2.5 mL)→ 0.22 μm 过滤。⏸ 终产物 4°C 可存 1 天。
- 定量与质检:BCA 测浓度(3 L 预期约 3.5 mg);LAL 显色法测内毒素——0.01–0.1 EU/mL 低浓度标准曲线、样品 WFI 25 倍稀释三复孔;目标:工作浓度(1 μg/mL tau)下 ≤0.01 EU/mL。
- 分装与保存:LC-MS 验证 10 μL/管、聚纤维 500 μL/管、iPSC-小胶质细胞实验 20 μL/管;液氮速冻 −80°C(实测可存 1 年)。
| 培养规模 | tau 总产量 | 浓度 | 内毒素(原液) | 内毒素(EU/mg) | 工作浓度 1 μg/mL |
|---|---|---|---|---|---|
| 3 L | 3.55 mg | 1.6 mg/mL | 0.61 EU/mL | 0.38 | <0.01 EU/mL |
| 6 L | 4 mg | 1.6 mg/mL | 2.31 EU/mL | 1.43 | <0.01 EU/mL |
第五阶段:肝素诱导 tau 体外聚合(11 天)
- 冰上融化 500 μL 单体 tau;安全柜内配聚合体系:按浓度算 tau 摩尔数 → 加肝素储液至 tau:heparin = 4:1(摩尔比)(肝素现配 + 过滤,摩尔比务必精确)→ 加 1 μL 1 M DTT(终 2 mM)→ 轻柔混匀。
- 封口膜封管,37°C、250 rpm 振荡 11 天。替代:Thermomixer C 700 rpm(按轨道直径换算 r₂ = r₁×√(D₁/D₂),Innova 44 D=25 mm、Thermomixer C D=3 mm);换其他摇床建议实测验证。
- 第 11 天质检:BCA 浓度;负染 TEM(样品 1:20 稀释,10 μL 滴新辉光放电 300 目碳膜铜网 2 min,2% 醋酸铀负染 20 s);FRET biosensor 播种实验——Tau RD P301S 细胞 25,000/孔铺 96 孔板,Lipofectamine 2000 转染 50 nM 纤维(2× 纤维液 100 nM 10 μL/孔 + 转染液 1 μL Lipo2000 + 9 μL Opti-MEM/孔,等体积混合室温 20 min,每孔加 20 μL 不换液;阴性对照 = 10 μL 转染液 + 10 μL Opti-MEM;3 技术重复);48 h 后 EVOS 成像观察包涵体;BD Fortessa ×20 流式 405 nm 激发、CFP 405/50 + FRET 525/50(⚠️ 488 nm 激光务必关闭),FlowJo v10 分析。纤维液氮速冻 −80°C 可存 1 年。
预期结果
- 3 L 菌液 IMAC 得 35–40 mg 融合蛋白;SENP2 1:100 即切透;CIEX 后终产量 3–4 mg、浓度 1.5–1.6 mg/mL(仍可能有痕量截短片段,tau 极易截短但已大幅减少);
- 内毒素控制是核心成果:原液约 0.5–2.5 EU/mL,稀释到工作浓度后 ≤0.01 EU/mL,对 TLR4 激活可忽略;
- 纯化单体保留肝素诱导聚合能力,TEM 可见纤维、FRET biosensor 播种阳性(P<0.0001);纤维形貌与播种活性批间有波动,每批次做结构与功能双重 QC。
局限性
- 批间波动:产量、纯度、内毒素水平都可能有差异(tau 固有无序特性导致层析非特异互作),必须严格 QC;
- CIEX 结合不完全:IMAC 残留咪唑、pH 与离子强度影响结合,部分蛋白可能流失于流穿液;
- 体外纤维 ≠ 体内聚集体:肝素诱导纤维比脑源 tau 结构更不均一、缺少疾病相关翻译后修饰与辅因子、播种能力与细胞效应有差异;需更高生理相关性时可考虑用疾病来源提取物播种重组 tau。
Troubleshooting
| 问题 | 步骤 | 解决 |
|---|---|---|
| French Press 匀浆器堵塞 | 11 | 沉淀重悬彻底至无团块;必要时先过细胞筛再上机 |
| 裂解液黏稠、影响离心与纯化 | 11 | 黏稠源于基因组 DNA 释放:加大 DNase 浓度并保证作用时间 |
| 6xHis-SUMO3 标签切割不完全 | 22 | SENP2 活性受高盐/高咪唑抑制——切割与透析同步进行;避免酶反复冻融;小试优化酶底比;自提 SENP2 先验活性 |
| 透析过程样品丢失 | 23 | 多为透析袋渗漏:确认预湿、无破损、在保质期、两端夹紧;装样后竖立 30–60 s 检查渗漏与液面,有渗漏立即换袋 |
| 蛋白产量低 | 37 | 用对菌株(BL21 DE3)、IPTG 现配、裂解液含抑制剂、全程低温、保证破碎效率 |
| 终产物内毒素偏高 | 38 | 增加 Triton X-114 洗涤量并确保缓冲液 4°C(温度显著影响除毒素效率);复用柱彻底深度清洗;延长树脂孵育或重复过柱;复用树脂规范再生 |
| 纤维形成差或不形成 | 42–44 | 肝素现配并过滤、严格 4:1 摩尔比、按轨道直径换算转速;不完全可延长孵育并以 TEM 确认 |
资源与数据
- 通讯作者:Sally A. Cowley(sally.cowley@path.ox.ac.uk);技术联系:Maria Kreger Karabova;
- 质粒 pETM11-Sumo3-TauWT2N4R 已存 Addgene(Cat#249347);本文数据均含于论文正文。