GFP 拉不下来,先看标签暴露没有

产品性能解析 · Abcam

GFP 拉不下来,先看标签暴露没有

Anti-GFP antibody,兔多抗,九个应用方向

Abcam  ·  货号 Ab290

GFP 拉不下来,先看标签暴露没有

过表达 GFP 融合蛋白,WB 能看到条带,很漂亮。

换成 IP,拉下来的东西里没有互作蛋白。银染一看,几乎空白。

抗体没问题,蛋白也表达了。问题在标签被折叠包进去了,抗体够不着。

免疫沉淀 验证结果
图 1 免疫沉淀 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

标签在哪个端,决定能不能拉

GFP 是个桶状结构,N 端和 C 端在空间上位置不同。

融合在目标蛋白的 C 端,或者放在中间,GFP 的桶可能被目标蛋白的结构挡住。IP 需要抗体结合后还能被 beads 拉下来,空间位阻比 WB 敏感得多。

WB 之前样本被煮过、变性过,表位全暴露,所以能染出来。IP 在天然条件下做,抗体看到的是折叠好的构象。

这两个结果不一致,本身就是信息。

这支抗体的覆盖面

Ab290 是兔多克隆,抗 GFP。

应用列得比较长,WB、IHC、ELISA、IF/ICC、IF-FRO、IP、ChIP、EM,还有 IHC-Fl。九个方向里,IP、ChIP 和电镜是比较少见的组合。

厂家说明里写的是在 ELISA、电镜、ICC/IF、IHC 冷冻和石蜡切片、IP 和 WB 上都有验证。

九个应用方向里,IP 和 ChIP 是对抗体要求最高的两项。能同时做这两项的多抗不多,选型的时候可以省掉一次试错。

增加拉下来的概率

第一步,换构建。N 端标签和 C 端标签各做一个,哪个能拉用哪个。

第二步,缩短连接臂。标签和蛋白之间夹一段柔性 linker,空间上松一点。

第三步,裂解缓冲液减配。IP 用的缓冲液去污剂浓度低一些,保持复合物完整。NP-40 或低浓度 Triton 比 SDS 温和得多。

第四步,抗体量。IP 一般用 1 到 2 微克,多了只会增加非特异。

电镜那个应用

Ab290 有电镜验证记录,这件事对做免疫金标记的人有用。

免疫电镜对试剂的纯净度要求高,缓冲液里有 BSA 或者明胶的时候,金颗粒容易团聚。抗体用前离心一下,取上清。

标签这个东西,位置比种类重要。

关键参数

抗原名称 GFP
验证应用 WB, IHC, ELISA, IF/ICC, IF-FRO, IP, ChIP, EM, IHCFl
宿主/亚型 Rabbit / IgG
抗体类型 Polyclonal
储存条件 短期 +4°C;长期 -20°C
免疫沉淀 验证结果
图 2 免疫沉淀 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

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品牌 货号 品名
Abcam Ab290 Anti-GFP antibody 本文产品
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