GFP 拉不下来,先看标签在哪一头
Anti-GFP 多抗,WB 到免疫电镜六种应用

转染 48 小时收细胞,裂解之后加抗体过夜,第二天珠子上一看,几乎没有东西。
Western 上 GFP 信号很强,说明蛋白在,标签也在。
拉不下来,问题常出在标签被折叠挡住了。
融合蛋白的两种朝向
GFP 挂在目的蛋白的 N 端还是 C 端,决定了它暴露在溶液里的哪一面。
框进融合体之后,GFP 的桶状结构要完整折叠才有荧光。折叠完整的时候,多数表位在表面,抗体能结合;但如果融合的一方带膜结构域或者形成寡聚,GFP 可能被压进复合物的界面里。
过表达也是一个因素。蛋白量太高,形成聚集体或者包涵体,去垢剂打不开,抗体只能碰到表面的部分。
所以 WB 能看到条带,IP 拉不下来,这两件事不矛盾。WB 之前样品被煮沸变性,表位全露;IP 是在天然状态下抓。
产品页标的分子量是 27 千道尔顿,指的是 GFP 本身。融合蛋白的位置要按目的蛋白加上去算。
这支抗体的应用面
ab6556 是兔多克隆,IgG 亚型,靶点是 GFP 本身,不限于某个融合构建。
验证过的应用写了六种:WB、IHC、流式、ICC/IF、IP 和免疫电镜。
能做到电镜这一步的 GFP 抗体不多。免疫电镜要求抗体识别的表位在固定之后仍然保留,多抗在这一点上比单抗有优势,因为它认多个位点,个别位点被交联破坏也还有别的能用。
产品页没有写具体的反应种属,因为 GFP 是外源标签,种属不适用。
纯化方式是免疫原亲和纯化,液体剂型。多抗的批间差异靠每批的实测数据兜,换批之后先跑一孔确认。
拉不下来时的排查顺序
先换裂解条件。去垢剂从温和的 NP-40 换到 RIPA,看看能不能把融合蛋白从复合物里释放出来。
再换标签朝向。同一个目的蛋白做 N 端和 C 端两个构建,哪个能拉下来用哪个,这是最快的一条路。
第三个选项是交联。抗体先跟珠子交联,再孵育裂解液,可以避免重链轻链干扰判读。
珠子先用无关蛋白预孵育半小时,把非特异位点占住,背景会干净很多。
三条操作建议
IP 的裂解液里补蛋白酶抑制剂,GFP 融合蛋白容易被降解,拉下来的是片段。
免疫电镜的样品固定要兼顾膜结构和抗原性,固定过度就看不清金颗粒,固定不足膜会散。这部分的配方要按电镜平台的条件走。电镜的二抗要用金标记的小粒径颗粒,粒径大了钻不进致密结构。
流式检测 GFP 直接看荧光就行,不需要抗体。用抗体是为了放大弱信号,两者不要混着解释。
下一次做 IP,先取十分之一裂解液跑一遍 WB,确认蛋白确实进了上清。
关键参数
| 抗原名称 | GFP |
| 验证应用 | WB, IHC, FCM, IF/ICC, IP, EM |
| 宿主/亚型 | Rabbit / IgG |
| 抗体类型 | Polyclonal |
| 纯化方式 | Affinity purification Immunogen |
| 储存条件 | 短期 +4°C;长期 -20°C |
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| 品牌 | 货号 | 品名 |
|---|---|---|
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