增强子在哪,H3K27ac 说了算

产品性能解析 · Abcam

增强子在哪,H3K27ac 说了算

Anti-Histone H3 (acetyl K27),ChIP 级,增强子标记

Abcam  ·  货号 Ab4729

增强子在哪,H3K27ac 说了算

测序数据回来,一堆峰。

哪些是启动子,哪些是增强子,哪些只是背景噪音。H3K27ac 的峰能把这件事说清楚。

组蛋白 H3 第 27 位赖氨酸的乙酰化,标记的是活跃的染色质状态。启动子和增强子上都有,超级增强子上尤其明显。

免疫组化 验证结果
图 1 免疫组化 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

它和 H3K4me1 的分工

H3K4me1 标的是增强子的位置,不管它活不活跃。

H3K27ac 标的是活跃状态。两个一起看,能分出准备状态的增强子和正在工作的增强子。

做药物处理前后对比,H3K27ac 的变化往往比转录组更早出现。

这支抗体的位置

Ab4729,兔多克隆,靶点 H3 的乙酰化 K27,识别人、小鼠、大鼠、牛。

应用覆盖 WB、IHC、IF/ICC、ChIP 和肽段芯片。肽段芯片这一项,说明它的特异性在合成肽层面被验证过,对点突变和修饰位点的区分能力有数据支撑。

H3K27ac 的信号强弱和增强子活性相关,但别把它当定量指标用。ChIP 的富集倍数受交联、超声、抗体量三重影响,跨样本比较之前先把这三项统一。

ChIP 的几个关键点

超声片段控制在 200 到 500 bp。片段太大,峰的分辨率上不去。太小,核小体结构被破坏,修饰信号会丢。

抗体用量按 ChIP 反应的染色质总量算。通常 1 到 5 微克起始,具体看染色质浓度。

阴性对照要用修饰无关的 IgG,阳性对照可以用总 H3。两个都跑,才能判断体系通没通。

洗涤最后一步的盐浓度不要太高,乙酰化抗体的结合在低盐下更稳。

定量之前先看整体

ChIP-qPCR 挑几个已知位点验证,比如看家基因启动子和一个已知的沉默区。

前者应该有富集,后者应该没有。这一步花半天,能省掉后面测序返工的几万块。

修饰抗体的批次差异比普通抗体大,同一课题尽量用一个批号跑完。

关键参数

反应种属 Human, Mouse, Rat, Bovine
抗原名称 H3C1 acetyl K27
验证应用 WB, IHC, IF/ICC, ChIP, Peptide Array
宿主/亚型 Rabbit / IgG
抗体类型 Polyclonal
纯化方式 Affinity purification Immunogen
储存条件 短期 +4°C;长期 -20°C
细胞免疫荧光 验证结果
图 2 细胞免疫荧光 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

相关产品

点击货号或品名可查看生知库产品页的完整参数与报价。

品牌 货号 品名
Abcam Ab4729 Anti-Histone H3 (acetyl K27) antibody - ChIP Grade 本文产品
Abcam Ab177178 Anti-Histone H3 (acetyl K27) antibody [EP16602] - ChIP Grade
Abcam AB6002 Anti-Histone H3 (tri methyl K27) antibody [mAbcam 6002] - ChIP Grade
Abcam Ab10812 Anti-Histone H3 (acetyl K9) antibody - ChIP Grade

参数与产品价格以生知库产品页实时信息为准。文中实验图片取自厂家官网产品页,仅用于说明该抗体的验证情况。

特别声明

1、本页面内容包含部分的内容是基于公开信息的合理引用;引用内容仅为补充信息,不代表本站立场。

2、若认为本页面引用内容涉及侵权,请及时与本站联系,我们将第一时间处理。

3、其他媒体/个人如需使用本页面原创内容,需注明“来源:[生知库]”并获得授权;使用引用内容的,需自行联系原作者获得许可。

4、投稿及合作请联系:info@biocloudy.com。