没处理过的细胞,MMP9 本来就没信号

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没处理过的细胞,MMP9 本来就没信号

MMP9 兔单抗,1/1000 到 1/20000

Abcam  ·  货号 Ab76003

没处理过的细胞,MMP9 本来就没信号

未刺激的 THP-1 裂解液跑 MMP9,1/1000 空的。学生加到 1/200,还是空的。怀疑抗体有问题。

翻说明书,厂家自己写了一行,未处理的细胞系在 1/200 时检测不到或者只有弱带,建议先用能上调 MMP9 表达的处理。

这句话把问题说清楚了。不是抗体不行,是样本里本来就没有。

Western blot 验证结果
图 1 Western blot 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

分泌蛋白在哪儿

MMP9 也叫明胶酶 B,是分泌型的。合成之后走分泌途径出去,细胞裂解液里留下的是前体和少量胞内库存。

要看它的表达或者活性,上清比裂解液更有价值。收上清之前先换无血清培养基,饿十二到二十四小时,把血清里的蛋白酶背景降下来。

上清里的浓度低,需要浓缩。超滤管选截留分子量合适的,离心条件按管子说明走。

浓缩倍数要记下来。上样的时候按原体积折算,否则处理组和对照组的上样量对不上,比值全乱。

这支的事实

克隆号 EP1254,兔单抗,IgG。反应种属写了人、大鼠两个。

应用四项,WB、IHC、FCM、IF/ICC。IHC-P 1/1000,未纯化用 1/100 到 1/250,需要热修复。ICC/IF 1/250 到 1/500。

流式做胞内染色 1/1000,同型对照给的是 ab172730,兔单抗 IgG。

WB 的范围是 1/1000 到 1/20000,跨了一个数量级还多。这个跨度对应的是样本里靶蛋白丰度的差异,不是让随便挑一个用。

明胶酶原的带

MMP9 以酶原形式分泌,跑胶时常看到一条位置稍高的带,那是没被切掉前肽的形式。

激活之后前肽被切掉,位置低一截。两条带的相对深浅,反映的是激活的比例。

样本处理不当会假性激活。反复冻融、剧烈涡旋都能让前肽掉下来,看着像处理起了作用。

建议

刺激方案比抗体浓度更重要。诱导单核细胞贴壁,再加炎症因子,MMP9 的转录才会起来。不诱导,加到 1/50 也没用。

IHC 做肿瘤组织,先看间质和炎症细胞密集的区域。MMP9 主要由巨噬细胞和中性粒细胞分泌,肿瘤实质细胞里的信号往往弱。

流式用 1/1000,做胞内染色要先固定再透化,同型对照一管不能省。

明胶酶谱是另一条路。把明胶掺进胶里,跑完洗掉 SDS,孵育过夜,酶活的地方会出现透明的带。WB 看的是蛋白量,酶谱看的是活性,两个数不一定同向。

上清收下来先低速离心去掉细胞碎片,再浓缩。碎片里的胞内酶原会一起进来,把没激活的样本测成激活的。

下次跑 MMP9,把上清和裂解液并排上样。哪一管出带,后面就只收那一管。

关键参数

反应种属 Human, Rat
抗原名称 Mmp9
验证应用 WB, IHC, FCM, IF/ICC
宿主/亚型 Rabbit / IgG
抗体类型 Monoclonal
纯化方式 Affinity purification Protein A
推荐稀释 IHC-P 1/1000 For unpurified use at 1/100 - 1/250. Perform heat-mediated antigen retrieval before commencing with IHC staining protocol.;WB 1/1000 - 1/20000 Based on our preliminary data, ab76003 detects no or weak band of interest in the untreated cell lines at the dilution of 1/200. Treatment increasing the expression of MMP-9 is recommended when using this antibody.;ICC/IF 1/250 - 1/500;Flow Cyt (Intra) 1/1000 ab172730 - Rabbit monoclonal IgG, is suitable for use as an isotype control with this antibody.
储存条件 短期 +4°C;长期 -20°C
Western blot 验证结果
图 2 Western blot 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

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