总 STAT3 做 CUT&RUN 前先验证

产品性能解析 · Abcam

总 STAT3 做 CUT&RUN 前先验证

兔单抗,88 kDa,含 CUT&RUN-seq

Abcam  ·  货号 Ab68153

总 STAT3 做 CUT&RUN 前先验证

细胞核提取物跑 STAT3,88 kDa 的位置有带,处理组和对照组差不多深。

同一批样本跑磷酸化 STAT3,处理组明显变深。

总蛋白没动,磷酸化上去了。这个结果说明通路被激活,但不说明 STAT3 的总量有变化。两支抗体测的是两件事。

Western blot 验证结果
图 1 Western blot 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

总蛋白和磷酸化的分工

STAT3 被 JAK 激酶磷酸化以后形成二聚体,进核,结合到靶基因的启动子上。

磷酸化是开关,总量是池子大小。做通路抑制实验,两个数都要有。

同一条蛋白上有几个磷酸化位点,Y705 和 S727 常被分开看。做通路激活用前者,做丝裂原响应用后者,抗体的名字要看全。

做 CUT&RUN 和 ChIP,需要的是能认出染色质结合态 STAT3 的抗体,这个要求和 WB 不一样。变性条件下的好抗体,在非变性条件里不一定行。

这支的事实

兔单抗,克隆号 EPR787Y,IgG,无标记,Protein A 纯化。产品页标注分子量 88 kDa。

种属写了人、小鼠、大鼠。应用列了 WB、IHC-P、IF/ICC、流式胞内和 CUT&RUN-seq 五项。

稀释比,WB 1/1000 到 1/2000,IHC-P 1/200,ICC/IF 1/200,流式胞内 1/30 到 1/50。

产品页提到有 20 µL 的试用装,先试再放大,这个规格对做条件摸索的人省事。

缓冲液 pH 7.2 到 7.4,含 40% 甘油和 0.05% BSA。

CUT&RUN 的前置验证

先用 qPCR 验一个已知靶点,看富集倍数,别一上来就做全基因组测序。

每次反应的细胞数固定,抗体量才好评,不同细胞数之间不能直接比富集倍数。

阴性对照用不带靶点的基因区域,阳性对照用已知的 STAT3 结合位点。

建库前先跑一次 qPCR,富集倍数到五倍以上再往下做。

细胞数按 5 万到 50 万起,太少背景高,太多染色体缠在一起切不动。

抗体用量比 WB 高得多,20 µL 试用装刚好够摸两次条件。

建库前先看片段分布,集中在核小体之间那段才说明酶切到位,不然测出来的峰全是假象。

三条操作建议

WB 上样 20 到 30 µg,1/1000 起,别一上来就用 1/2000。

核转位判读要比核和胞质的信号,只看核内绝对亮度会被曝光带偏。

IF 做核转位,刺激后固定,看核内信号有没有增强,别只看总量。

CUT&RUN 前先跑一次 WB,确认这支在你手上的样本里能出单一条带。

下次做抑制剂实验,总 STAT3 和磷酸化 STAT3 一起跑,比例才是结论。

关键参数

反应种属 Human, Mouse, Rat
抗原名称 STAT3
验证应用 WB, IHC, FCM, IF/ICC, CUT&RUN-seq
宿主/亚型 Rabbit / IgG
抗体类型 Monoclonal
纯化方式 Affinity purification Protein A
推荐稀释 IHC-P 1/200 For unpurified use at 1/140.;WB 1/1000 - 1/2000;ICC/IF 1/200 For unpurified use at 1/140.;Flow Cyt (Intra) 1/30 - 1/50
储存条件 短期 +4°C;长期 -20°C
Western blot 验证结果
图 2 Western blot 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

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