50 kDa 那条带,别和它抢位置

产品性能解析 · Abcam

50 kDa 那条带,别和它抢位置

Anti-beta III Tubulin 兔多抗,敲除验证

Abcam  ·  货号 Ab18207

50 kDa 那条带,别和它抢位置

做原代神经元的那组,第十四天收样跑胶。目的蛋白在 48 kDa,内参选了 beta III Tubulin,显出来一条很粗的带。

问题是两条带挨得太近,扫膜的时候框重叠,定量软件把灰度算到了一起。

换内参不是唯一解法,先弄清楚这条带为什么在这个位置。

免疫组化 验证结果
图 1 免疫组化 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

TUBB3 是神经元的结构蛋白

beta III Tubulin 是微管蛋白的一个亚型,在神经元里高表达,也是神经前体细胞往神经元分化时最早变化的标志之一。

产品页标的分子量是 50 kDa。微管蛋白在细胞里不是单体,它会聚成微管,也会形成二聚体。样本裂解得不够彻底的时候,部分蛋白以聚合态存在,进胶慢,条带会往上拖。

煮沸时间也有影响。微管蛋白对反复冻融和长时间高温敏感,煮十分钟以上容易看到聚集在浓缩胶边上。

敲除验证与种属覆盖

产品页写明这支的特异性在敲除样本里做过确认。对多抗来说,这一条比什么都实在。

多抗是混合克隆,不同批次之间的表位偏好会有差异。敲除样本做出的阴性结果,说明在这套体系里,抗体认的就是这个基因的产物,不是别的蛋白碰巧同位置。

做流式胞内染色的时候,这一条尤其重要。固定破膜之后,细胞里的结构蛋白暴露面变了,非特异结合的机会增加。带一个敲除或者敲低样本做对照,比单纯看同型对照更有说服力。

反应种属是人、小鼠、大鼠、猴、鱼。

鱼样本在神经发育研究里用得不少,斑马鱼的脊髓和视网膜结构清楚。做这类样本的时候,固定时间和脱钙步骤会影响染色,抗体本身的交叉反应通常不是瓶颈。

猴的样本更多用在毒理和示踪,切片往往已经存了一段时间。存档切片的抗原性下降,修复强度要往上提一档再试。

与常见内参的位置冲突

beta III Tubulin 在 50 kDa,beta actin 在 42 kDa,GAPDH 在 36 kDa 附近。三个数挨得近,配胶浓度低的时候容易挤在一起。

做神经样本,如果目的蛋白也在 45 到 55 kDa 之间,把胶的浓度提到 12%,或者干脆分两块胶跑。

扫膜的框要手动划,不要用自动识别。相邻条带被框进去一点,定量结果就偏一成。

三条操作建议

裂解液里加足够的去垢剂,微管蛋白在温和裂解条件下容易留在不溶相,上清里的量偏低。收样后超声几秒,比单纯涡旋有效。

孵育温度统一。四度过夜和室温两小时,条带的锐度不一样,同一次实验里不要混着来。

流式做胞内染色,破膜后加一步封闭,用含血清的缓冲液孵育二十分钟再上抗体。

下次配胶前,先看一眼目的蛋白的分子量,和 50 kDa 隔开 5 kDa 以上,再决定用不用这支做内参。

关键参数

反应种属 Human, Mouse, Rat, Monkey, Fish
抗原名称 TUBB3
验证应用 WB, IHC, FCM, IF/ICC
宿主/亚型 Rabbit / IgG
抗体类型 Polyclonal
纯化方式 Affinity purification Immunogen
储存条件 短期 +4°C;长期 -20°C
流式细胞术 验证结果
图 2 流式细胞术 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

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