c-Myc 的半衰期,短到能毁掉一批样本
Anti-c-Myc [Y69],兔单抗,ChIP 与 CUT&RUN 验证

六孔板放在冰上,一孔一孔刮下来。刮到第四孔的时候,计时器已经走了十二分钟。
跑完胶,c-Myc 的条带比预期浅很多。
这个蛋白的半衰期只有半小时左右。样本处理慢一点,测到的就是降解后的量。
为什么 c-Myc 难测
c-Myc 是转录因子,靠泛素化途径快速周转。
细胞状态一变,蛋白水平就跟着变。血清饥饿、接触抑制、甚至换液这个动作,都会让它在半小时内掉下去。
所以测 c-Myc,比的不是抗体,是收样的速度。
同样的道理适用于其他短半衰期的转录因子,收样流程要按它们的节奏设计。
设计流程时把这半小时算进去,比事后补实验省事。
Y69 这支克隆的参数
Ab32072 是 Y69 克隆,兔单克隆,IgG 亚型,识别人、小鼠、大鼠的 c-Myc。
验证应用给得很全。WB、IHC-P、流式胞内、ICC/IF、IP,还标注了 ChIP-seq 和 CUT&RUN-seq。
稀释比和用量分开。WB 1/1000,IHC-P 5 微克每毫升,ICC/IF 5 到 10 微克每毫升,流式胞内 1/50,IP 5 微克每毫升。
做 IP 和 CUT&RUN 是按微克给的,不是按稀释比,换算的时候注意。
一支抗体同时覆盖 IP 和 CUT&RUN,做蛋白-DNA 互作的课题可以少买一支。
验证列表长,说明厂家在这几个系统里都跑出过结果,选型时省掉不少试错。
收样的具体做法
培养基倒掉,立刻加冰上预冷的 PBS 洗一遍,加裂解液,全程在冰上。
裂解液里现加蛋白酶抑制剂。PMSF 单独加,它自己也会水解,配好半小时内用完。
做 ChIP,交联要在收样后马上做,甲醛固定能把蛋白的周转停住。
做降解实验,加放线菌酮之后按时间点收,从 0 到 60 分钟,每 15 分钟一个点。
每个时间点直接加 SDS 上样缓冲液煮沸,别先冻存再处理。
IP 和 CUT&RUN 的差别
IP 拉内源 c-Myc,5 微克每毫升对常规细胞量够用。细胞数增加,抗体按比例加。
CUT&RUN 对细胞数要求低,几百到几万个细胞都能做,抗体量不用跟着降太多。
两者的染色质片段要求不一样。IP 要 200 到 500 bp,CUT&RUN 不用超声,靠核酸酶切。
对照也不一样。IP 用 IgG,CUT&RUN 还要加外源 DNA 做封闭。
下一批样本,六孔板全部放在冰上一起处理,收完第一孔开始计时,看能不能压到五分钟以内。
关键参数
| 反应种属 | Human, Mouse, Rat |
| 抗原名称 | MYC |
| 验证应用 | WB, IHC, FCM, IF/ICC, IP, ChIP-seq, CUT&RUN-seq |
| 宿主/亚型 | Rabbit / IgG |
| 抗体类型 | Monoclonal |
| 纯化方式 | Affinity purification Protein A |
| 推荐稀释 | IHC-P 5 µg/mL ab172730 - Rabbit monoclonal IgG, is suitable for use as an isotype control with this antibody. Perform heat-mediated antigen retrieval before commencing with IHC staining protocol.;WB 1/1000;ICC/IF 5-10 µg/mL 1/100.;Flow Cyt (Intra) 1/50 |
| 储存条件 | 短期 +4°C;长期 -20°C |
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| 品牌 | 货号 | 品名 |
|---|---|---|
| Abcam | Ab32072 | Anti-c-Myc antibody [Y69] - ChIP Grade 本文产品 |
| Abcam | Ab9132 | Anti-Myc tag antibody - ChIP Grade |
| Abcam | Ab185656 | Anti-c-Myc (phospho S62) antibody [EPR17924] |
| Abcam | Ab9106 | Anti-Myc tag antibody |
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