GSDMD 要看两条带

产品性能解析 · Abcam

GSDMD 要看两条带

兔单抗 [EPR19828],仅小鼠,54 kDa

Abcam  ·  货号 Ab209845

GSDMD 要看两条带

焦亡模型,LPS 预处理加尼日利亚菌素刺激,收样跑 GSDMD。

只看到 54 kDa 那条全长带,切割带没有出现。

加长刺激时间,降低上样量,还是没有。

换了一支抗体之后才明白,问题在样本处理,不在抗体。

Western blot 验证结果
图 1 Western blot 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

全长和切割带要分开看

GSDMD 被 caspase 切割后,N 端片段约 31 kDa,是打孔的执行者。

产品页给的分子量是 54 kDa,指的是全长。

如果只看到全长,先确认刺激是否真的激活了炎症小体,阳性对照跑一个经典诱导条件。

切割带的信号通常比全长弱,上样量少的时候容易看不见,曝光时间要给够。

全长条带的强弱不代表焦亡程度,看的是切割带与全长的比值。

31 kDa 附近还有别的蛋白,判读时要对着分子量标记看,别只凭有没有带下结论。

另外,N 端片段会穿孔,样品里若有没裂解的细胞,测出来的切割比例会偏低。

样品煮沸前先超声三次,每次五秒,聚集体打散了条带才干净。

这支的事实

兔单抗,克隆号 EPR19828,IgG,无标记,Protein A 亲和纯化。

种属只写了小鼠,应用只列 WB 和 IP 两项,规格有 100 µL 和 1 mL 两种。

产品页提到特异性在 GSDMD 敲除的 RAW 264.7 细胞里做过 WB 验证。

缓冲液是 PBS 加 40% 甘油和 0.05% BSA,pH 7.2 到 7.4,含 0.01% 叠氮钠。

人样本不在种属清单里,做人源细胞要另找一支。

IP 抓 GSDMD 的注意点

GSDMD 会寡聚化,裂解液里加 1% NP-40 有助于打散聚集体。

N 端片段有膜结合能力,裂解前不要做超速离心去膜,否则会把它丢掉。

IP 后跑 WB,IgG 重链在 50 kDa,正好压在 GSDMD 全长附近,选轻链特异性二抗。

拉下来的样品要还原煮沸,否则寡聚体停在胶的上端,看着像没拉下来。

如果只关心切割,用 IP 反而绕远,直接跑 WB 加长曝光更直接。

切割带始终出不来,换一个刺激条件比换抗体更值得试。刺激前先做 LPS 预刺激四小时,这一步省了后面全白做。

三条操作建议

一抗稀释比产品页没有给,WB 从 1/1000 起,IP 每管 2 到 4 µg。

刺激后用含 1% SDS 的裂解液直接煮,能同时看到全长和切割带。

上样量按总蛋白 30 µg,切割带弱的话单独上一块胶,曝光拉长。

下次同一批样本跑一块 12% 的胶,把 54 和 31 kDa 都留在胶里。

关键参数

反应种属 Mouse
抗原名称 GSDMD
验证应用 WB, IP
宿主/亚型 Rabbit / IgG
抗体类型 Monoclonal
纯化方式 Affinity purification Protein A
储存条件 短期 +4°C;长期 -20°C
Western blot 验证结果
图 2 Western blot 验证结果(图源:Abcam 官网产品页)

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品牌 货号 品名
Abcam Ab209845 Anti-GSDMD antibody [EPR19828] 本文产品
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